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Génomique des paysages
Lire la suite : Génomique des paysagesIntroduction « Génomique des paysages » cela sonne comme le titre d’une œuvre d’Eduardo Kac. Ce nom un peu post-moderne désigne en fait une discipline scientifique qui a connu une expansion fulgurante au cours de la dernière décennie. Les enjeux environnementaux et de conversation actuels ont rendus pressante la nécessité de mieux comprendre et décrire les espèces […]
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Sept problèmes fascinants posés par les récepteurs olfactifs
Lire la suite : Sept problèmes fascinants posés par les récepteurs olfactifsLe cinquième va vous étonner ! Introduction : l'olfaction, un sens assez bien compris et compréhensible L’olfaction n'est peut-être pas le plus noble des sens, comparé à la vue ou l’ouïe par exemple, mais il s'agit d'un sens assez bien compris aujourd'hui. C'est notamment grâce aux travaux des biologistes Linda B. Buck et Richard Axel, récompensés par […]
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L'intérêt d'une communauté scientifique bioinformatique
Lire la suite : L'intérêt d'une communauté scientifique bioinformatique"Tout seul on va plus vite, ensemble, on va plus loin". Proverbe africain Il est un constat que je fais de plus en plus souvent et qui m'attriste à chaque fois un peu plus : notre belle société semble tendre vers l'individualisme. Il est probable que l'émergence des réseaux sociaux et à l'actuel culte du nombrilisme […]
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Rendre un pipeline Snakemake à l'épreuve des plateformes
Lire la suite : Rendre un pipeline Snakemake à l'épreuve des plateformesPour avoir été client des articles ("Snakemake pour les nuls", "Formaliser ses protocoles avec Snakemake" et "Snakemake, aller plus loin avec la parallélisation") de mon prédécesseur lelouar, j'ai décidé d'apporter ma pierre à l'édifice et de continuer cette série sur Snakemake. Je vais ici vous parler de généralisation de pipeline pour l'utilisation intensive au sein […]
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ISMB/ECCB 2019 & live-tweet : comment raconter l'un en utilisant l'autre avec R ?
Lire la suite : ISMB/ECCB 2019 & live-tweet : comment raconter l'un en utilisant l'autre avec R ?En cette magnifique rentrée 2019/2020, laissez-moi vous parler encore un peu de cet été, et plus particulièrement de la conférence ISMB/ECCB, référence en bio-informatique, qui s'est déroulée du 21 au 25 juillet dernier à Bâle. Et pour cela, je vais allier l'utile à l'agréable en vous présentant ce qu'est le live-tweet et comment bien le […]
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Les tests en bioinformatique
Lire la suite : Les tests en bioinformatiqueTester est-ce douter ? Aujourd'hui on va parler d'un truc très connu des informaticiens mais encore trop peu connu en bio-informatique : les tests. Cette pratique est pourtant conseillée dans le guide du bon broinformaticien . Alors, qu'est ce qu'un test ? Un test désigne une procédure de vérification d'un système. Son objectif principal est d'identifier un nombre […]
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Rentrée 2019/2020, la bio-informatique de retour !
Lire la suite : Rentrée 2019/2020, la bio-informatique de retour !Les bureaux sont à nouveau pleins, les projets arrivent en masse, l'IRC du blog se repeuple petit à petit avec des nouvelles têtes… Pas de doutes, c'est bien la rentrée, et le site sort de sa torpeur pour relancer la machine à articles autour de la bioinformatique ! On espère voir de nouveaux auteurs se manifester, […]
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Une pause s'impose
Lire la suite : Une pause s'imposeLa chaleur est là, les collègues se font tour à tour plus rares dans les bureaux, et qu'on soit en congés ou pas encore, on apprécie cette période estivale pour ce qu'elle signifie : repos et calme. Pour le blog, auteurs comme admins, tout le monde a le droit à sa période de pause. Mais il […]
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