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Les tests en bioinformatique
Lire la suite : Les tests en bioinformatiqueTester est-ce douter ? Aujourd'hui on va parler d'un truc très connu des informaticiens mais encore trop peu connu en bio-informatique : les tests. Cette pratique est pourtant conseillée dans le guide du bon broinformaticien . Alors, qu'est ce qu'un test ? Un test désigne une procédure de vérification d'un système. Son objectif principal est d'identifier un nombre […]
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Rentrée 2019/2020, la bio-informatique de retour !
Lire la suite : Rentrée 2019/2020, la bio-informatique de retour !Les bureaux sont à nouveau pleins, les projets arrivent en masse, l'IRC du blog se repeuple petit à petit avec des nouvelles têtes… Pas de doutes, c'est bien la rentrée, et le site sort de sa torpeur pour relancer la machine à articles autour de la bioinformatique ! On espère voir de nouveaux auteurs se manifester, […]
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Une pause s'impose
Lire la suite : Une pause s'imposeLa chaleur est là, les collègues se font tour à tour plus rares dans les bureaux, et qu'on soit en congés ou pas encore, on apprécie cette période estivale pour ce qu'elle signifie : repos et calme. Pour le blog, auteurs comme admins, tout le monde a le droit à sa période de pause. Mais il […]
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Pourquoi vous avez besoin d'un blog scientifique !
Lire la suite : Pourquoi vous avez besoin d'un blog scientifique !Mon titre étant volontairement provocateur je vais commencer par le modérer et l'expliquer. Vous n'avez pas forcément besoin de votre blog, vous avez besoin d'un espace ou vous pouvez écrire des textes structurés avec des tableaux, des images et la possibilité de les rendre publics facilement. Un dépôt Github comme un compte Twitter peuvent ainsi […]
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Les problèmes limités par les entrées/sorties (IObound)
Lire la suite : Les problèmes limités par les entrées/sorties (IObound)Dans la première partie de ce tutoriel , j'ai expliqué ce qu’était la programmation concurrente et parallèle, ainsi que détaillé les différents types de programmation concurrente et leurs spécificités. Si vous ne l'avez pas lue, je vous conseille de la lire avant de démarrer. Dans cette deuxième partie, nous allons nous concentrer sur l'optimisation d'un […]
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Télécharger des données de séquençage sur le NCBI.. pour les débutants !
Lire la suite : Télécharger des données de séquençage sur le NCBI.. pour les débutants !Toi petit étudiant de M1 qui arrive en premier jour de stage… Viens par ici… Oui TOI ! Toi à qui ton maître de stage te demande de récupérer les données de séquençage d'un article vachement bien, sans que tu saches le faire… TOI ! Toi le physicien qui se met à la biologie mais qui ignore […]
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Rendre ses projets R plus accessibles grâce à Shiny
Lire la suite : Rendre ses projets R plus accessibles grâce à ShinyVous avez un script que vous souhaitez partager avec une équipe expérimentale ? Vous ne voulez pas que les utilisateurs modifient le code pour paramétrer votre programme ? Vous codez avec R ? Alors cet article est fait pour vous ! Nous allons voir comment créer une application web avec R et permettre à votre utilisateur d’exécuter votre code […]
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Présentation du parcours de bio-informatique BIM à Nice
Lire la suite : Présentation du parcours de bio-informatique BIM à NiceLe parcours bio-informatique BIM existe en licence et en master, à Nice, depuis plus de 10 ans. À l'occasion de sa refonte en 2019, une petite présentation s'impose ! Présentation Le parcours bio-informatique BIM a pour objectif de former des étudiants ayant une formation initiale en biologie et/ou bio-informatique aux approches de bio-informatique, d'analyse de données […]
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