• Revue de presse : les articles de février que vous avez (peut-​être) lus

  7 mars 2012

  -

  par

  Malicia

  dans Journal Club

  

  Ce billet est le premier de notre nouvelle rubrique Journal Club (JC pour les intimes). Le JC est le moment où on parle de papiers récents proches des thématiques de recherche des gens de l'équipe. La bio-​informatique n'échappe pas à cette tradition : étant un domaine en constante évolution et passionnante ébullition, un tas d'études et nouvelles méthodes d'analyse est publié régulièrement. Ainsi, mettre certaines d'entre elles en exergue ici nous a semblé une bonne idée. Bonne lecture ! Et n'oubliez pas : les commentaires sont là pour entamer la discussion et aller plus loin 😉 Un rapide tour des journaux du mois de…

  Lire la suite : Revue de presse : les articles de février que vous avez (peut-​être) lus

• Transformer une sortie de Blast xml en format GenBank

  6 mars 2012

  -

  par

  Aurélien C.

  dans Astuce

  

  Bonjour, et bienvenu dans mon premier article concernant mon script Perl Blast2Gb​.pl. Ce dernier illustre parfaitement ce qu'on peut faire facilement et rapidement avec un script Perl : du traitement de texte. Cet outil permet de faciliter la vie et de transformer une tâche laborieuse en un traitement rapide et efficace. En effet, qui ne s'est jamais retrouvé avec une sortie de BLAST qu'il voudrait regarder dans un programme de visualisation de séquences (comme Geneious par exemple) mais qui ne prend pas les sorties de BLAST ? Ou encore, devant soumettre un génome au NCBI, mais qui n'a pas envie de se…

  Lire la suite : Transformer une sortie de Blast xml en format GenBank

• Edito

  29 février 2012

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Editorial

  Bonjour. Aujourd'hui est un grand jour. Nous ouvrons le site bioinfo-​fr. Depuis quelque temps, nous formons une équipe éparse de bioinformaticiens francophones à travers le monde. Chaque jour, nous échangeons des idées, points de vue, partageons nos expériences communes à travers certains groupes de discussions (principalement le channel IRC #bioinfo-​fr sur Freenode où vous pouvez nous retrouver). Mais ces échanges restaient confinés à un petit comité or nous voulons maintenant laisser une empreinte et faire découvrir notre domaine. Notre domaine ? La bioinformatique. Un champ d'application et de recherche né de la rencontre entre la biologie et l'informatique. Un domaine très vaste et pluridisciplinaire…

  Lire la suite : Edito

• Les langages de programmation

  29 février 2012

  -

  par

  Gophys

  dans Découverte

  

  Bonjour à tous et toutes, j'ai l'honneur d'écrire l'un des tout premiers articles du blog Bioinfo-​fr. Étant (presque) plus passionné par l'informatique que par la biologie, je vais vous expliquer l'un des outils les plus importants pour un bioinformaticien : la programmation. En effet, il n'existerait pas de bioinformatique sans informatique et donc sans programmation. Pour ceux qui ne le savent pas, la programmation, c'est ce qui permet de créer un programme. Jusque-​là, rien de particulièrement exotique. Ce qui l'est davantage, c'est qu'il existe plusieurs langages de programmation, chacun ayant ses qualités et ses défauts. Comme un langage naturel, ils ont…

  Lire la suite : Les langages de programmation

Articles les plus lus ces 7 derniers jours

Utilisateur/utilisatrice4 juin 2024Les admin·e·s

Salons de discussion4 janvier 2024I. Stévant

Représenter le métabolisme - les réseaux métaboliques7 avril 2016Bunny