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GPGPU, le "supercalculateur" du pauvre
Lire la suite : GPGPU, le "supercalculateur" du pauvreEn bioinformatique, nous sommes souvent amenés à travailler avec des données à grande échelle. Il suffit de voir le nombre de publications incluant les termes “large-scale”, “extensive” ou encore “high-throughput” pour s’en rendre compte. Dans la majorité des cas, on est satisfait du développement d’un outil quand celui-ci fait son job correctement en se souciant […]
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Présentation du Master Bioinformatique de Bordeaux
Lire la suite : Présentation du Master Bioinformatique de BordeauxPrésentation Foyer du fondateur de #bioinfo-fr (ainsi que quelques habitués), le Master de BioInformatique de l’Université Bordeaux 1 existe depuis 2003. Les cours sont dispensés à la fois sur le campus Pessac/Talence (université de Bordeaux 1) et le campus Carreire (université de Bordeaux Segalen). Ces deux campus se partagent respectivement les cours du domaine informatique […]
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Débuter avec l'API Ensembl (Perl)
Lire la suite : Débuter avec l'API Ensembl (Perl)But : Découvrir comment on peut accéder très simplement aux informations d'Ensembl à l'aide d'un script Perl. Niveau : débutant. Pré-requis : Avoir des notions de Perl allant jusqu'à l'utilisation de librairies. Avoir accès à une machine où les librairies Perl d'Ensembl sont installées. Parmi les sites agrégeant de l'information biologique, Ensembl fournit une API (Application Programming Interface) […]
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Edito
Lire la suite : EditoEt bien voila, notre premier mois d'existence vient de passer. Encore une fois, merci à vous pour votre toute jeune et fraîche fidélité, nous espèrons pouvoir vous contenter ainsi encore pendant longtemps ! L'heure est venue de faire place aux chiffres, car les chiffres parlent toujours mieux que des mots.D'après notre outil d'analyse voici ce qu'il […]
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