L'équipe va se dorer la pilule !

Ça y est, nous y sommes ! La fin de l'été s'annonce, nous sommes de moins en moins nombreux dans les bureaux, c'est l'heure de partir sur les plages, ou en montagne, ou dans une contrée virtuelle.

Bref, vous l'aurez compris, le blog se met en pause pour le mois d'Août :) ! Mais ne vous inquiétez pas, vous pourrez retrouver très bientôt de nouveaux articles tous beaux, qui sentent bon le sable chaud, dès le mois de Septembre !

Hum, farniente ! | Photo par sisterlmonkey0, CC0

Hum, farniente ! | Photo par sisterlmonkey0, CC0

Profitez donc de ce laps de temps pour aller vous détendre ou, si vous n'êtes pas des fanatiques de l'oisiveté, vous pouvez aussi faire des devoirs (articles) pendant notre absence. Nous sommes toujours aussi friands de nouveau contenu :) !

Notre équipe d'enfer se joint à moi pour vous souhaiter, à tous, de bonne vacances !

Édito

Actualité :
3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage

Vous n'avez pas encore équipé votre ordinateur de SSD ? Et bien vous pouvez abandonner le projet… En effet Intel, en partenariat avec Micron, a présenté le 28 juillet une nouvelle technologie de stockage 3D XPoint (prononcez trois dés ixe point three di cross point).
3D XPoint est bien plus rapide que le stockage flash équipant les SSD, mais aussi votre smartphone, votre clé usb ou votre montre connectée...

Didacticiel :
Cours de R pour débutant pressé : les régressions !

Bonjour à tous et soyez les bienvenus dans ce 3ème cours de R pour débutant pressé.
Aujourd’hui, nous allons voir rapidement ce qu’est une régression (linéaire ou quadratique), à quoi ça sert et ce que ça peut nous apprendre sur nos données.
Ne vous êtes-vous jamais demandé comment en apprendre plus sur vos données, comment savoir quel paramètre est le plus important ou plus simplement s’il est possible « de faire une belle ligne sur mon graphique » ?
Non ? Ah… et bien merci à bientôt...

Didacticiel :
Python, dessine-moi un graphe

Derrière ce titre énigmatique, qui n'aura pas été sans vous rappeler la fameuse phrase du Petit Prince d'Antoine de Saint Exupéry, se cache un module pour Python qui dira sûrement quelque chose à nos lecteurs assidus spécialisés dans les graphes : pygraphviz !
Ce module a été créé autour de GraphViz et vous permet ainsi de faire des graphes sous Python en respectant les normes établies par GraphViz et, par conséquent, d'exporter ou d'importer très facilement vos graphes pour vos différents projets...

Astuce :
Inkscape : l'outil idéal pour vos figures et posters

Je sais pas pour vous mais dans mon labo, le premier réflexe de mes collègues lorsqu'il faut faire une figure ou un poster c'est soit de dégainer la suite Ad*be, soit d'ouvrir P*werPoint. Quel est le problème me direz-vous ? Outre le fait qu'ils soient très coûteux pour le labo/l'université/l'entreprise où vous travaillez, ces outils ne sont pas forcément adaptés à l'usage que vous en faites...

Découverte :
Vers une meilleure encryption des données génétiques

La démocratisation du séquençage du génome humain, ouvrant les portes de la médecine personnalisée, provoque aussi beaucoup d'inquiétudes au sujet de la protection des données. La séquence unique de l'ADN d'un individu, en effet, peut indiquer entre autres les prédispositions à des maladies, la tolérance à diverses substances, les traits potentiels de la descendance, le phénotype de l'individu, son origine, etc...

Découverte :
Twitter, arme de communication massive et outil scientifique

Twitter est un réseau social incontournable. Son principe est simple, il s'agit de s'échanger avec ses "followers", des messages ou "tweets" de 140 charactères maximum. Il est surtout utilisé aux Etats-Unis, mais la fièvre Twitter gagne peu à peu l'Europe.  De nombreux scientifiques, chefs de labos, doctorants et même des institutions informent par ce biais. En créant votre compte vous pourrez avoir un accès direct à toutes ces personnes (en tant que suiveur) et vous pourrez leur poser des questions au moyen de messages directs (DM)...

Didacticiel :
Git : cloner un projet, travailler à plusieurs et créer des branches

 Git est un logiciel de contrôle de versions de fichiers. Il est distribué sous licence GNU GPLv2 et est disponible sur les principaux systèmes d'exploitation.
Dans l'article précédent, nous avions vu comment installer et configurer git, comment créer un dépôt pour un projet, ainsi que les principes de base de gestion de versions.
Dans cet article, nous verrons comment cloner un projet (par exemple pour travailler à plusieurs ou pour faire des sauvegardes), comment synchroniser les différentes copies tout en détectant et résolvant les problèmes éventuels, et comment créer des branches et indiquer les étapes qui correspondent à des versions...

Actualité :
La bière décodée dans un Hackuarium

Vous aimez la bière et la science ? Vous voulez connaître la composition de votre mousse favorite ? Vous avez envie de goûter de nouvelles bières proches de celles que vous connaissez, ou complètement différentes ?
Il y a quelques temps déjà, je vous ai décrit la place de la bioinformatique dans les laboratoires citoyens. Aujourd'hui, un projet sympathique de séquençage et d’analyse biochimique voit le jour à Renens (Suisse, VD)...

Astuce :
Créer sa carte géographique avec R

Aujourd’hui je vais vous montrer comment, en utilisant R, on peut faire de belles cartes géographiques.
Et là, vous allez me demander, mais pourquoi faire des cartes géographique ? Et pourquoi avec R ?
Et bien imaginons que, vous, bioinformaticien de terrain, soyez allé échantillonner des animaux à l’autre bout du monde sur plusieurs sites, par exemple des Marsupilami (totalement au hasard !)...

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