• Bioconvert - simplifier les conversions de formats

  17 octobre 2018

  -

  par

  Nico M.

  dans Découverte

  Bioconvert Qui n'a jamais eu à conver­tir un fichier de don­nées bio­lo­giques dans un autre for­mat ? Il y a bien sur le clas­sique fastq vers fas­ta, pour lequel nombre d'entre nous ont codé un conver­tis­seur "mai­son", pas for­cé­ment opti­mal. D'autres for­mats sont par­fois plus pro­blé­ma­tiques, par exemple la conver­sion vers et depuis GFF2/​GFF3. De ces dif­fé­rents […]

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• Transformer une carte de contact chromosomique en une structure 3D

  10 octobre 2018

  -

  par

  Léopold Carron

  dans Suivez l'guide

  

  Après vous avoir mon­tré tout un tas de choses sur com­ment visua­li­ser et extraire une carte, je vais vous mon­trer aujourd'hui com­ment une carte de contact chro­mo­so­mique peut être obser­vée sous la forme d'une struc­ture 3D à par­tir de VMD. Pour cela nous allons par­tir de la méthode déve­lop­pée dans mon labo­ra­toire : Shrec3D. Cet article […]

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• En Automne, les articles tombent des arbres

  3 octobre 2018

  -

  par

  Yoann M.

  dans Editorial

  

  Nous revoi­là de notre pause esti­vale ! C'est l'Automne et nous dis­tin­guons déjà quelques articles prêts à tom­ber de notre bel arbre ! Nous en pro­fi­tons pour rap­pe­ler que sans le tra­vail des auteurs et des relec­teurs, ce blog n'en serait pas là aujourd'hui. Nous sommes tou­jours ouverts à de nou­velles col­la­bo­ra­tions, cha­cun d'entre nous ayant quelque […]

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• #JOBIM2018 : une étude de réseau

  3 octobre 2018

  -

  par

  Eorn

  dans Suivez l'guide

  

  Comme une par­tie de la com­mu­nau­té bio­in­for­ma­tique fran­çaise, et pro­ba­ble­ment du lec­to­rat de ce blog, je me suis ren­du à la 19è édi­tion des Jour­nées Ouvertes en Bio­lo­gie, Infor­ma­tique et Mathé­ma­tiques (JOBIM). Celle-ci se tenait à Mar­seille, au Palais du Pha­ro, et pour celles et ceux d'entre vous curieux·ses de connaître le conte­nu scien­ti­fique, voi­là […]

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• Vacances estivales

  6 juillet 2018

  -

  par

  Yoann M.

  dans Editorial

  

  Notre mis­sion d'avant l'été est rem­plie : Main­te­nant, il ne tient qu'à vous de faire vivre tout ça. Nous pro­po­sons, vous dis­po­sez. Avant de vous sou­hai­ter de bonnes vacances d'été nous vou­lions aus­si vous rap­pe­ler que sans vous ce blog n'en serait pas là.C'est un peu de tous ceux qui ont vou­lu y ajou­ter leur petit […]

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• canSnippet : le voilà !

  4 juillet 2018

  -

  par

  Yoann M.

  dans Découverte

  

  Nous vous l'avions annon­cé il y a qua­si­ment un an jour pour jour lors de notre pré­sen­ta­tion à JOBIM2017 à Lille. Il est main­te­nant là, dis­po­nible, consul­table et à por­tée de tous : canS­nip­pet Com­mu­ni­ty Edi­tion. A vos marques pages, c'est ici que ça se pas­se­ra doré­na­vant : https://​cans​nip​pet​.bioin​fo​-fr​.net/ ! Le principe Avoir une col­lec­tion de snip­pets […]

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• Enquête Bioinfo-fr 2018 : un portrait de la bioinformatique

  28 juin 2018

  -

  par

  Gwenaelle

  dans Bioinformatique

  

  Après 1 mois et demi d'enquête et 1 mois et demi d'attente, voi­ci donc l'article tant pro­mis qui va décor­ti­quer vos réponses !  Nous tenons par ailleurs à remer­cier tout les répon­dants qui ont don­né de leur temps et qui auront par­ta­gé ce son­dage dans leur entou­rage. Mer­ci d'avoir contri­bué à cette enquête. 🙂 L'intégralité des […]

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• Clôture de l'enquête !

  14 mai 2018

  -

  par

  Gwenaelle

  dans Editorial

  

  Notre recueil d'informations est à pré­sent ter­mi­né. Un grand mer­ci à tout​.es nos 417 répondant.e.s ! Nous sommes heu­reux de voir la mobi­li­sa­tion de la com­mu­nau­té bioin­fo. Place main­te­nant à l'analyse des réponses pour en tirer la sub­stan­ti­fique moelle et dres­ser un por­trait des bio-infor­ma­ti­ciens 😉 On se retrouve d'ici fin mai/​début juin pour un article […]

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