• 6 ans… et des questions !

  12 mars 2018

  -

  par

  Yoann M.

  dans Editorial

  

  Vous ne le saviez peut-être pas mais nous venons de souf­fler fiè­re­ment notre sixième bou­gie ! 6 ans ! Que de savoir autour de la bio­in­for­ma­tique par­ta­gé ! Mer­ci à toutes et à tous pour vos sou­tiens sans faille. On vou­lait mar­quer le coup cette année : nous avons donc mis en place un ques­tion­naire orien­té autour du quo­ti­dien […]

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• Inkscape pour biologistes

  8 mars 2018

  -

  par

  Florian Jeanneret

  dans Didacticiel

  

  Fini les rec­tangles pour faire des pro­téines ou les images pixe­li­sées cho­pées sur des sites dou­teux ! Dans 10 minutes vous serez un pro d'Inks­cape qui est un logi­ciel gra­tuit pour "des­si­ner" avec une prise en main très rapide per­met­tant de réa­li­ser des figures vec­to­rielles, non construites en pixels, pou­vant être alors redi­men­sion­nées à l'infini en conser­vant […]

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• Apprivoiser l'ami ursidé de Python : Pandas

  8 février 2018

  -

  par

  Jnsll

  dans Découverte, Didacticiel

  

  Durant mon stage de M2, j’ai eu l’occasion de cha­touiller ce drôle d’animal qu’est pan­das. En effet, j’ai tra­vaillé sur des don­nées de pro­téo­mique conte­nues dans des fichiers tabu­lés. Il s'agissait de com­pa­rer la pré­sence des pro­téines ou leur expres­sion dans dif­fé­rents échan­tillons. Les abon­dances rela­tives (la variable étu­diée) étaient indi­quées pour les dif­fé­rentes pro­téines […]

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• Et surtout : la bonne année !

  17 janvier 2018

  -

  par

  Yoann M.

  dans Editorial

  

  Bonne année 2018 à vous tous les Gee­kus bio­lo­gi­cus !D'une pierre deux coups : nos vœux et la reprise des publi­ca­tions. N'hésitez pas à venir toquer à la porte si jamais l'envie vous prend de rédi­ger un ou plu­sieurs articles ! Mer­ci encore pour vos encou­ra­ge­ments et votre sui­vi ! Gwe­naëlle, Isa­belle, Yohan et Yoann pour l'ensemble de l'équipe […]

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• Les commandements du stagiaire en bioinformatique

  17 janvier 2018

  -

  par

  Yoann M.

  dans Opinion

  

  La période des stages n'est pas loin et toi, jeune étudiant(e) bioinformaticien(ne) — futur(e) sta­giaire, te demandes com­ment choi­sir par­mi toutes ces annonces. Pas de panique, c'est tout à fait nor­mal de se poser toute une ribam­belle de ques­tions, nous y sommes tous pas­sés. La bonne nou­velle c'est que c'est ton jour de chance : les […]

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• Fêtes de fin d'année et hibernation annuelle

  22 décembre 2017

  -

  par

  Gwenaelle

  dans Editorial

  

  Les pre­miers flo­cons de neige sont tom­bés, le vin chaud emplit les narines, les sapins conquièrent les salons, et un cer­tain bar­bu enva­hit notre envi­ron­ne­ment. En cette fin d'année, voi­ci pour nous le moment de faire notre courte hiber­na­tion pour pré­pa­rer la tran­si­tion vers la nou­velle année. Nous tenions cepen­dant, avant de par­tir, à remer­cier […]

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• Qu'est-ce qu'un site d'initiation de la transcription ?

  21 décembre 2017

  -

  par

  Guillaume Devailly

  dans Découverte

  

  Comment je me suis posé la question. Chez les euca­ryotes, l'ADN est orga­ni­sé en domaines plus ou moins com­pac­tés, avec des taux de trans­crip­tion plus ou moins éle­vés, et qui sont mar­qués dif­fé­ren­tiel­le­ment par un cer­tain nombre de marques épi­gé­né­tiques (méthy­la­tion de l'ADN, modi­fi­ca­tions post-tra­duc­tion­nelles des his­tones, variants d'histones, etc.). Il est fré­quent d'essayer de […]

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• LaTeX : automatisez le traitement des CSV

  7 décembre 2017

  -

  par

  m4rsu

  dans Didacticiel

  

  Vous avez peut-être vu l'excellent article de Cho­po­pope sur l'utilisation des flot­tants en LaTeX, et en par­ti­cu­lier la par­tie sur la créa­tion de tableaux. Non ? Pour les retar­da­taires, c'est par ici… Vous vous êtes sur­ement ren­du compte que créer des tableaux peut être long et fas­ti­dieux. De plus, en bons bio­in­for­ma­ti­ciens, vos don­nées tabu­lées sont […]

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