Bioinfo-fr.net

Customiser matplotlib (faire son matplotlibrc)

30 novembre 2017

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par

Maria Pommeret

dans Astuce

Suite à une mésaventure liée à matplotlib sur le chan IRC #bioinfo-fr (mésaventure suite aux fameuses erreurs de display ; si vous voulez tout savoir : si on configure mal son matplotlib on peut générer des erreurs qui font qu'on obtient des images vides… voir la partie sur le backend plus tard :o), j'ai parlé de la […]
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Les bases de données de séquençage : GEO, SRA, ENA, ArrayExpress

22 novembre 2017

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par

Guillaume Devailly

dans Découverte

De nos jours, lors de la publication de résultats, il est nécessaire de rendre public les éventuelles données de séquençage générées. Si un faible nombre d’irréductibles continuent à ne fournir les données que sur demande, les bonnes pratiques poussent à les déposer dans des bases de données librement accessibles. Quatre grandes bases de données de séquençage […]
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Maîtrisez le cache de Rmarkdown !

15 novembre 2017

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par

Aurélien C.

dans Astuce, Didacticiel

Pour des raisons de reproduction de la science, il est important de conserver une trace de tout ce que l'on fait sur son ordinateur. Pour cela, faire des rapports est la meilleure manière que je connaisse qui permette d'inclure le code et les résultats d'une analyse. Pour faire ça bien avec R, on a déjà […]
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LaTeX : les maths !

2 novembre 2017

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par

Maria Pommeret

dans Didacticiel

Après avoir appris à compiler, à insérer des flottants et à mettre en forme les paragraphes, on va s'attaquer à un truc plutôt coolish qui fait la force de LaTeX : la mise en forme de maths ! Comme c'est long et vaste, on va faire ça en plusieurs fois 😉 ! Tables des matières : 1. Ce qu'il […]
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Jouer avec l'API de KEGG

18 octobre 2017

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par

Nolwenn

dans Didacticiel

Il n'est pas rare que nous ayons un jour besoin de récupérer des informations de la base de données KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). Cette base de données fournit un nombre conséquent d'informations sur les génomes et les réseaux de gènes mais également sur les voies métaboliques ou les maladies. Dans ces cas […]
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Petite introduction sur… les éléments répétés

11 octobre 2017

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par

Léopold Carron

dans Didacticiel

Suite à l'excellent billet proposé par un autre auteur du blog, de nombreuses questions sur ce que sont les éléments répétés sont restées en suspens. Après le séquençage du génome humain dans les années 2000, de nombreux chercheurs ont constaté que la majeure partie du génome n'était pas composée de gènes, mais d'ADN à l'époque […]
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LaTeX : la mise en forme du texte et des paragraphes

4 octobre 2017

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par

Maria Pommeret

dans Didacticiel

Bon maintenant qu'on sait compiler et insérer des flottants, un truc critique à voir c'est comment mettre en forme : mettre en italique, en emphase, en gras, souligner, faire des listes à puces, insérer du code… Préparez-vous, ça risque d'être un peu long :). (Et par un peu long je veux aussi dire un peu enquiquinant, […]
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Au boulot !

4 octobre 2017

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par

Yoann M.

dans Editorial

Comme diraient quelques personnes de petites tailles mondialement connues : "♫ Eh oh, eh oh, on s'en va au boulot ! ♫ ". Car oui, c'est aujourd'hui la reprise chez bioinfo-fr.net ! On espère vous avoir manqué (un peu) et que ce qu'on vous a préparé pour la rentrée vous satisfera ! Le planning de publication a été refait, […]
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