Qui sommes nous ?
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We are still alive !
Lire la suite : We are still alive !Cela faisait trop longtemps que nous n'avions pas posté de nouvel édito !Pour faire court : Très bon ensoleillement à tous !
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Questions à… Jean-Marc Victor
Lire la suite : Questions à… Jean-Marc VictorRetranscription de la Table Ouverte en bioinformatique (TOBi) du mois d'avril 2017 avec Jean-Marc Victor, directeur de recherche CNRS au LPTMC et responsable du GdR ADN. Pouvez-vous vous présenter ?Jean-Marc Victor : Je ne suis pas bioinformaticien. Je suis un peu bio, mais pas trop informaticien. Et je suis physicien. Et il parait que c'est la première fois […]
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Identification des relations entre la variabilité génétique et le phénotype : cartographie QTL
Lire la suite : Identification des relations entre la variabilité génétique et le phénotype : cartographie QTLLes individus d’une même espèce, à moins qu’ils ne soient des clones identiques, sont tous légèrement différents les uns des autres. Cette différence s’exprime à tous les niveaux, de l’apparence (phénotype macroscopique), au génome (différents allèles pour le même gène), en passant par les phénotypes microscopiques (aussi appelés moléculaires - on pensera ici aux transcriptomes, […]
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Représenter rapidement une ACP avec R et ggplot2
Lire la suite : Représenter rapidement une ACP avec R et ggplot2Je ne sais pas pour vous, mais moi, à chaque fois que j'assiste à une réunion de labo, il y a quasi systématiquement un graphique d'ACP pour montrer les données. Et à chaque fois, il s'agit d'un graphique de base, généré avec R, avec la fonction plot(), des couleurs qui piquent les yeux et des […]
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Questions à… Marie Beurton Aimar
Lire la suite : Questions à… Marie Beurton AimarRetrouvez ici la retranscription de la première Table Ouverte en BIonformatique (TOBi) organisée à Lyon le 16 mars 2017 Clément DELESTRE (CD) : Merci d'être présente pour ce premier TOBi à Lyon, est-ce que tu peux nous présenter ta formation, ton parcours, etc ? Marie Beurton-Aimar (MBA) : On va rire là… Alors moi je suis […]
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"IRC ? Mais c'est quoi en fait ?"
Lire la suite : "IRC ? Mais c'est quoi en fait ?"EDIT Nous avons migré du réseau freenode au réseau libera. Plus d'informations dans cet article : Migration de notre IRC de Freenode vers Libera. Les informations concernant IRC en général restent toutefois à jour dans l'article ci-dessous. Cette question, je l'entends maintenant depuis pas mal de temps quand je parle du blog à mon entourage (étudiants […]
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Eh toi ! rev_comp, tu l'écris comment ?
Lire la suite : Eh toi ! rev_comp, tu l'écris comment ?Écrire un algorithme de rev_comp ou complément inverse, on l'a tous déjà fait. Aujourd'hui c'est devenu un classique des cours d'algorithmique en étude de bioinformatique, c'est un algorithme simple mais qui demande de savoir utiliser les structures de contrôle de base. À la fois un bon exercice pratique et pédagogique, doit-il cependant rester implémenté comme […]
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Retour d'expérience : bonnes pratiques à appliquer en cas de déréférencement Google (et autres)
Lire la suite : Retour d'expérience : bonnes pratiques à appliquer en cas de déréférencement Google (et autres)Avertissement : cet article déroge exceptionnellement à la ligne éditoriale que nous nous sommes imposées depuis le début de l'aventure. Nous n'allons pas parler de bioinformatique de près ou de loin dans cet article. Quoique les plus enthousiastes d'entre vous pourraient dire que cela peut arriver à une application web bioinfo 🙂 Mise en bouche Nous […]
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