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Virtualisez pour plus de reproductibilité
Lire la suite : Virtualisez pour plus de reproductibilitéVirtualisez pour plus de reproductibilité Pour commencer Vous avez entendu parler de reproductibilité. Vous voulez vous y mettre ? Vous vous dites que la virtualisation vous aiderait à utiliser toujours la même version d'un outil précis. En savoir plus sur Docker vous aiderait bien ? Cet article est donc pour vous. Je profite de l'occasion pour parler […]
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Pimp my workstation : avoir le terminal le plus classe du bureau !
Lire la suite : Pimp my workstation : avoir le terminal le plus classe du bureau !Mise en place de zsh et d'un dossier .dotfiles Introduction Qu'est-ce que c'est que zsh ? Il s'agit (comme nous indique aimablement sa page Wikipédia) d'un shell unix. En gros, il s'agit d'un remplaçant potentiel pour votre vénérable interpréteur bash. Mais pourquoi se casser le beignet à installer zsh, alors que j'ai déjà bash ? zsh a […]
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We are still alive !
Lire la suite : We are still alive !Cela faisait trop longtemps que nous n'avions pas posté de nouvel édito !Pour faire court : Très bon ensoleillement à tous !
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Questions à… Jean-Marc Victor
Lire la suite : Questions à… Jean-Marc VictorRetranscription de la Table Ouverte en bioinformatique (TOBi) du mois d'avril 2017 avec Jean-Marc Victor, directeur de recherche CNRS au LPTMC et responsable du GdR ADN. Pouvez-vous vous présenter ?Jean-Marc Victor : Je ne suis pas bioinformaticien. Je suis un peu bio, mais pas trop informaticien. Et je suis physicien. Et il parait que c'est la première fois […]
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Identification des relations entre la variabilité génétique et le phénotype : cartographie QTL
Lire la suite : Identification des relations entre la variabilité génétique et le phénotype : cartographie QTLLes individus d’une même espèce, à moins qu’ils ne soient des clones identiques, sont tous légèrement différents les uns des autres. Cette différence s’exprime à tous les niveaux, de l’apparence (phénotype macroscopique), au génome (différents allèles pour le même gène), en passant par les phénotypes microscopiques (aussi appelés moléculaires - on pensera ici aux transcriptomes, […]
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Représenter rapidement une ACP avec R et ggplot2
Lire la suite : Représenter rapidement une ACP avec R et ggplot2Je ne sais pas pour vous, mais moi, à chaque fois que j'assiste à une réunion de labo, il y a quasi systématiquement un graphique d'ACP pour montrer les données. Et à chaque fois, il s'agit d'un graphique de base, généré avec R, avec la fonction plot(), des couleurs qui piquent les yeux et des […]
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Questions à… Marie Beurton Aimar
Lire la suite : Questions à… Marie Beurton AimarRetrouvez ici la retranscription de la première Table Ouverte en BIonformatique (TOBi) organisée à Lyon le 16 mars 2017 Clément DELESTRE (CD) : Merci d'être présente pour ce premier TOBi à Lyon, est-ce que tu peux nous présenter ta formation, ton parcours, etc ? Marie Beurton-Aimar (MBA) : On va rire là… Alors moi je suis […]
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"IRC ? Mais c'est quoi en fait ?"
Lire la suite : "IRC ? Mais c'est quoi en fait ?"EDIT Nous avons migré du réseau freenode au réseau libera. Plus d'informations dans cet article : Migration de notre IRC de Freenode vers Libera. Les informations concernant IRC en général restent toutefois à jour dans l'article ci-dessous. Cette question, je l'entends maintenant depuis pas mal de temps quand je parle du blog à mon entourage (étudiants […]
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