Bioinfo-fr.net

Septembre, rentrée et nouveauté !

16 septembre 2015

-

par

Les admin·e·s

dans Editorial

Septembre est là et l'été s'éloigne. Plus que 11 mois avant de repartir en vacances ! Afin de vous faire patienter jusque-là, l'équipe de bioinfo-fr n'a pas chômé et va revenir en mode publication dès la semaine prochaine. En guise de teasing et pour vous faire patienter voici quelques informations sur ce qui va se passer la semaine prochaine : le premier article sera un gros dossier sur JOBIM2015. Qu'est-ce qui s'est passé à Clermont-Ferrand durant ces 4 jours ? Qu'est-ce qui s'est dit ? Qui faut-il suivre cette année (à part nous !) ? Quel temps fera-t-il le 28 février prochain ? Vous saurez…
Lire la suite : Septembre, rentrée et nouveauté !
L'équipe va se dorer la pilule !

2 août 2015

-

par

Les admin·e·s

dans Editorial

Ça y est, nous y sommes ! La fin de l'été s'annonce, nous sommes de moins en moins nombreux dans les bureaux, c'est l'heure de partir sur les plages, ou en montagne, ou dans une contrée virtuelle. Bref, vous l'aurez compris, le blog se met en pause pour le mois d'Août 🙂 ! Mais ne vous inquiétez pas, vous pourrez retrouver très bientôt de nouveaux articles tous beaux, qui sentent bon le sable chaud, dès le mois de Septembre ! Profitez donc de ce laps de temps pour aller vous détendre ou, si vous n'êtes pas des fanatiques de l'oisiveté, vous pouvez…
Lire la suite : L'équipe va se dorer la pilule !
3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage

29 juillet 2015

-

par

Julien Fumey

dans Actualité, Brèves, Découverte

Vous n'avez pas encore équipé votre ordinateur de SSD ? Et bien vous pouvez abandonner le projet… En effet Intel, en partenariat avec Micron, a présenté le 28 juillet une nouvelle technologie de stockage 3D XPoint (prononcez trois dés ixe point three di cross point). 3D XPoint est bien plus rapide que le stockage flash équipant les SSD, mais aussi votre smartphone, votre clé usb ou votre montre connectée. L'ordre de grandeur annoncée est de 1 000 fois. Autrement dit la latence de ces supports de stockage sera en nanosecondes contre des millisecondes pour les SSD. On se rapproche de plus en plus de…
Lire la suite : 3D XPoint : une nouvelle technologie de stockage
Les 10 ans de la SFBI

24 juillet 2015

-

par

Julien Fumey

dans Brèves

C'est une info passée un peu inaperçue et pourtant… La Société Française de Bioinformatique (SFBI) fête, cette année, ses 10 années d'existence ! Et oui, déjà ! Bon anniversaire à elle ! ♫ Joyeux anniversaire, Joyeux anniversaire la SFBI etc. ♫ Pour fêter ses 10 ans, la SFBI veut changer son identité visuelle et dans un premier temps en changeant son logo. Elle vous propose donc de participer à un concours de création de logo. Le vainqueur gagnera : une inscription à JOBIM 2016 qui aura lieu à Lyon du 28 au 30 juin, un an d'adhésion à la SFBI ainsi qu'une surprise !…
Lire la suite : Les 10 ans de la SFBI
Cours de R pour débutant pressé : les régressions !

15 juillet 2015

-

par

Aurélien C.

dans Didacticiel, Suivez l'guide

Bonjour à tous et soyez les bienvenus dans ce 3ème cours de R pour débutant pressé. Aujourd’hui, nous allons voir rapidement ce qu’est une régression (linéaire ou quadratique), à quoi ça sert et ce que ça peut nous apprendre sur nos données. Ne vous êtes-vous jamais demandé comment en apprendre plus sur vos données, comment savoir quel paramètre est le plus important ou plus simplement s’il est possible « de faire une belle ligne sur mon graphique » ? Non ? Ah… et bien merci à bientôt. Si ? Ah c’était une blague… très bien, continuons alors. Commençons par le début et demandons-nous ce qu’est…
Lire la suite : Cours de R pour débutant pressé : les régressions !
Python, dessine-moi un graphe

9 juillet 2015

-

par

Nolwenn

dans Didacticiel

Derrière ce titre énigmatique, qui n'aura pas été sans vous rappeler la fameuse phrase du Petit Prince d'Antoine de Saint Exupéry, se cache un module pour Python qui dira sûrement quelque chose à nos lecteurs assidus spécialisés dans les graphes : pygraphviz ! Ce module a été créé autour de GraphViz et vous permet ainsi de faire des graphes sous Python en respectant les normes établies par GraphViz et, par conséquent, d'exporter ou d'importer très facilement vos graphes pour vos différents projets. Sans plus attendre, attaquons-nous à quelques exemples d'utilisations du module. Prêts ? Graphez ! Installation de pygraphviz Dans un premier temps, il…
Lire la suite : Python, dessine-moi un graphe
Inkscape : l'outil idéal pour vos figures et posters

2 juillet 2015

-

par

I. Stévant

dans Astuce, Didacticiel

Je sais pas pour vous mais dans mon labo, le premier réflexe de mes collègues lorsqu'il faut faire une figure ou un poster c'est soit de dégainer la suite Ad*be, soit d'ouvrir P*werPoint. Quel est le problème me direz-vous ? Outre le fait qu'ils soient très coûteux pour le labo/l'université/l'entreprise où vous travaillez, ces outils ne sont pas forcément adaptés à l'usage que vous en faites. Le premier est souvent trop compliqué et très lourd, et le second n'est carrément pas fait pour ça. Il existe cependant un outil simple, gratuit, léger et puissant mais assez méconnu du grand public (et…
Lire la suite : Inkscape : l'outil idéal pour vos figures et posters
Vers une meilleure encryption des données génétiques

24 juin 2015

-

par

Julien Delafontaine

dans Découverte

La démocratisation du séquençage du génome humain, ouvrant les portes de la médecine personnalisée, provoque aussi beaucoup d'inquiétudes au sujet de la protection des données. La séquence unique de l'ADN d'un individu, en effet, peut indiquer entre autres les prédispositions à des maladies, la tolérance à diverses substances, les traits potentiels de la descendance, le phénotype de l'individu, son origine, etc. Dans les "biobanques", des bases de données comprenant le code génétique de nombreux volontaires sont en cours de construction et ne feront que grandir. A titre d'exemple, le CHUV de Lausanne, précurseur européen dans le domaine, possède actuellement dans…
Lire la suite : Vers une meilleure encryption des données génétiques