Qui sommes nous ?
Une communauté d'étudiants et de professionnels
Une base d'articles libres pour tous niveaux
Des salons de discussion actifs au quotidien
-
Joyeux code et bonnes analyses !
Lire la suite : Joyeux code et bonnes analyses !Toute l'équipe de bioinfo-fr.net se joint à moi pour vous souhaiter de très bonnes fêtes de fin d'année !On espère que vous avez été sages et gentils durant cette année qui s'achève et que le Papa Noël vous amènera plein de nouveaux projets, de nouvelles données et de nouvelles publications. Quant à nous, nous reviendrons avec […]
-
De la nécessité d’une pratique collaborative en bioinformatique
Lire la suite : De la nécessité d’une pratique collaborative en bioinformatiqueDepuis l’avènement des algorithmes d’alignement de séquences jusqu’aux outils d’analyses de réseaux de protéines, la bioinformatique se cherche une définition et une place dans la science. Est-ce une discipline ? Est-ce un outil ? Quelle formation faut-il avoir pour être bioinformaticien ? Et à quoi ressemblerait idéalement un diplôme en bioinformatique ? On sera tous d’accord qu’il n’y a […]
-
Open Refine
Lire la suite : Open RefineUn grand coup de balai Le nettoyage de données est un défi en bioinformatique. Entre les personnes qui veulent réinventer les standards et les personnes qui ne savent pas les suivre, nous nous trouvons souvent en train de nettoyer, de formater et de changer la structure de nos données pour qu'elles soient conformes à une […]
-
Python fait la numba
Lire la suite : Python fait la numbaSuite à cet article, j'ai eu envie de comparer les temps d'exécution de Cython et Numba.Il est toujours intéressant de faire des tests de performances (benchmarks) de temps à autre, pour voir si on ne peut pas améliorer certains de nos algorithmes 🙂 Cython est un très bon moyen pour optimiser vos programmes, mais il […]
-
Le recrutement en bioinfo
Lire la suite : Le recrutement en bioinfoOncle Sam le dit : "I want you". Et il n'est pas le seul. En cette période de crise, le marché de la bioinfo se porte plutôt pas trop mal. Cela dit, il y a beaucoup de candidats et on peut facilement passer à coté d'une offre si on ne fait pas attention à quelques détails. […]
-
Les 10 ans du World Community Grid
Lire la suite : Les 10 ans du World Community GridLe 16 novembre 2014, le World Community Grid (WCG) fête ses 10 ans d’existence. Créé par IBM en 2004, ce projet de grille de calcul distribué par ordinateur se donne pour mission de soutenir des projets de recherche à fins humanitaires. Selon Wikipedia, une grille de calcul est une infrastructure virtuelle "qui exploite la puissance […]
-
Comparaison de structures : le TM-Score
Lire la suite : Comparaison de structures : le TM-ScorePour comparer des structures 3D de protéines, nous avons vu le RMSD dans un précédent article. Je vous propose cette semaine de parler du TM-Score décrit par Zhang et Skolnick en 2004. Les bases Le TM-Score a été développé afin de calculer la qualité des structures de protéines prédites lors de la compétition CASP5. Le but […]
-
Hi‑C : Quelques bases
Lire la suite : Hi‑C : Quelques basesAujourd'hui on va découvrir ensemble une des petites dernières dans la famille des techniques hauts débits : le High Chromosome Contact map (Hi C)[1] . Revenons sur quelques bases : un gène ne pourra être exprimé que si l'ADN qui le code est déplié. Par conséquent les régions dans lesquelles les gènes ne sont pas exprimés sont […]
Articles les plus lus ces 7 derniers jours
Chargement ...Les salons de discussion :
La boutique
Quelques liens
Étiquettes
ADN analyse base de données bioinformatique code concours conférence débutant Découverte edito emploi formation Génomique Interview JeBiF JOBIM langage master outil programmation Python R Recherche rentrée script SFBI statistiques séquençage tutoriel vacances visualisation