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Edito
Lire la suite : EditoBonjour à tous, Nouvelle semaine qui commence et donc nouveaux articles en prévision. Tout d'abord merci à tous pour votre intérêt.À titre d'information, nous avons dénombré quelques 1100 visiteurs uniques le jour de l'annonce sur la liste de la SFBI. Merci encore à eux pour ce fantastique moyen de diffusion.Notre objectif est donc de vous […]
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Alignements multiples : quels logiciels choisir ?
Lire la suite : Alignements multiples : quels logiciels choisir ?Le but de cet article est de faire gagner du temps à vous, bioinformaticiens, qui comme moi auront un jour à travailler sur ce large sujet que sont les alignements multiples (ou MSA pour Multiple Sequence Alignements). Dans le cadre de mon travail, j’ai eu à réaliser des alignements de séquences sur un nombre de séquences […]
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Récupérer la fiche d'un gène avec les Eutils du NCBI
Lire la suite : Récupérer la fiche d'un gène avec les Eutils du NCBIEn bioinformatique il n'est pas rare que l'on ait besoin d’accéder à des informations disponibles sur des bases de données internationales, nous verrons ici le cas de la banque Gene du NCBI. Avant de s'intéresser à la récupération d'une fiche d'un gène en passant par les Eutils, un peu de théorie et d'explications sur une fiche […]
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Edito
Lire la suite : EditoBonjour. Après deux semaines d'existence, bioinfo-fr donne naissance à une rubrique : le journal-club. Cette rubrique mensuelle nous donne l'occasion de sélectionner certains papiers scientifiques d'intérêt bioinformatique. Je vous laisse découvrir plus en détails le premier volet. l’équipe bioinfo-fr
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Revue de presse : les articles de février que vous avez (peut-être) lus
Lire la suite : Revue de presse : les articles de février que vous avez (peut-être) lusCe billet est le premier de notre nouvelle rubrique Journal Club (JC pour les intimes). Le JC est le moment où on parle de papiers récents proches des thématiques de recherche des gens de l'équipe. La bio-informatique n'échappe pas à cette tradition : étant un domaine en constante évolution et passionnante ébullition, un tas d'études et nouvelles […]
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Transformer une sortie de Blast xml en format GenBank
Lire la suite : Transformer une sortie de Blast xml en format GenBankBonjour, et bienvenu dans mon premier article concernant mon script Perl Blast2Gb.pl. Ce dernier illustre parfaitement ce qu'on peut faire facilement et rapidement avec un script Perl : du traitement de texte. Cet outil permet de faciliter la vie et de transformer une tâche laborieuse en un traitement rapide et efficace. En effet, qui ne s'est […]
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Edito
Lire la suite : EditoBonjour. Aujourd'hui est un grand jour. Nous ouvrons le site bioinfo-fr. Depuis quelque temps, nous formons une équipe éparse de bioinformaticiens francophones à travers le monde. Chaque jour, nous échangeons des idées, points de vue, partageons nos expériences communes à travers certains groupes de discussions (principalement le channel IRC #bioinfo-fr sur Freenode où vous pouvez nous […]
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