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Pourquoi écrire sur un blog communautaire ?
Lire la suite : Pourquoi écrire sur un blog communautaire ?7 ans… 7 ans entre l'écriture de mon premier article ici et aujourd'hui. De cette longue route m'est venue l'envie de faire un billet personnel sur pourquoi à mon sens, un blog communautaire a plus d'importance qu'un blog personnel. Les réflexions qui suivent sont totalement personnelles et n'engagent que moi. * Mon histoire sur ce […]
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Pourquoi certains fichiers FASTQ finissent par 001 ?
Lire la suite : Pourquoi certains fichiers FASTQ finissent par 001 ?Sur le chan IRC du blog, un de nos membres se demandait pourquoi les noms de fichiers FASTQ devait finir par _001.fastq sur la plateforme de cloud computing d'Illumina BaseSpace. Mais avant de répondre à cette question pressante, repartons du début. Les fichiers FASTQ En cette période de domination du séquençage haut débit de l'ADN, […]
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Migration de notre IRC de Freenode vers Libera
Lire la suite : Migration de notre IRC de Freenode vers LiberaVous le savez sûrement, Bioinfo-fr ce n'est pas qu'un blog, c'est aussi un salon de discussion (ou chat) en ligne pour discuter en direct. Historiquement, notre salon IRC (Internet Relay Chat) #bioinfo-fr était hébergé sur un réseau nommé Freenode, dédié aux projets et logiciels libres en tous genres. Ce réseau fondé en 1994, comptait en […]
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Installer JupyterHub pour des Notebooks hébergés sur votre serveur
Lire la suite : Installer JupyterHub pour des Notebooks hébergés sur votre serveurVous connaissez sans doute déjà les notebooks Jupyter [1], ces documents web où l'on peut rédiger du contenu en Markdown, pouvant contenir des formules mathématiques en LaTeX, mêlées à des cellules de code Python, (ou R, Julia etc.) que l'on peut exécuter au cas par cas de façon interactive. Ils sont pas mal utilisés en […]
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Organiser une conférence en ligne : trucs et astuces
Lire la suite : Organiser une conférence en ligne : trucs et astucesOrganiser une conférence est complexe. Mais organiser une conférence en ligne… c'est TRÈS complexe. Si l'ordinateur qui diffuse la conférence plante… comment prévenir l'audience ? La moindre erreur technique fait d'avantage peur car il devient plus difficile de rebondir et d’expliquer l'issue à la 'salle'. Aujourd'hui je vous propose un partage de toutes les stratégies envisagées pour […]
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C'est le printemps, on refait sa garde robe !
Lire la suite : C'est le printemps, on refait sa garde robe !Cela fait un an maintenant que la boutique du blog est disponible, il est temps de renouveler les modèles pour que vous puissiez défiler fièrement dans la rue, dans vos labo, dans vos facs avec vos nouveaux t‑shirts, tote bags, ou encore mugs et tapis de souris. On vous propose de nouveaux modèles en plus : […]
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9 ans, c'est pas tout neuf ! Et si c'était la dernière ?
Lire la suite : 9 ans, c'est pas tout neuf ! Et si c'était la dernière ?Cette année nous n'avons pas soufflé notre neuvième bougie car ce n'est "pas très COVID". Cette année nous avons regardé derrière nous et nous avons été plutôt fiers de tout ce que nous avons pu faire ici, tous ensemble. Et cette année enfin et surtout nous nous sommes demandés si cela n'allait pas être la […]
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Meet-4EU+, le bilan !
Lire la suite : Meet-4EU+, le bilan !Bien le bonjour amis lecteurs. Pour le billet du jour je vous propose une visite dans les coulisses d'un cours/projet déroulé cette année à l'université de la Sorbonne : Meet-4EU+. J'apporterai ainsi mon regard sur l'organisation de cette année, agrémentée de quelques petites anecdotes subjectives. L'idée de ce cours est de proposer aux étudiants de master […]
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