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  • Analyses bioinformatiques du coronavirus 2019-nCoV : pourquoi et comment ?

    Analyses bioinformatiques du coronavirus 2019-nCoV : pourquoi et comment ?

    À l'époque de paru­tion de cet article, le nou­veau nom de la pneu­mo­nie de Wuhan 'COVID-19' et le nom défi­ni­tif du virus 'SARS-CoV‑2' n'étaient pas connus. C'est pour­quoi vous trou­ve­rez encore dans l'article ci-des­sous l'ancien nom 2019-nCoV. Ce n'est plus un secret : à l'heure où ces lignes sont écrites le coro­na­vi­rus, 2019-nCoV de son petit…

  • Doctorant dis toi que…

    Doctorant dis toi que…

    Je vous pro­pose aujourd'hui un petit article résu­mant les tra­vers typiques pen­dant une thèse. Ces pro­pos sont pure­ment issus de mon expé­rience récente de thèse (finie en 2019) de thèse ain­si que d'autres doctorants/​docteurs dans mon entou­rage. Toute la suite de l'article ne reflète que mon opi­nion per­son­nelle de ce grand moment de la vie…

  • Et si votre bonne résolution vous rapportait un cadeau ?

    Et si votre bonne résolution vous rapportait un cadeau ?

    Bonne année très chers lec­teurs ! Nous vous sou­hai­tons que 2020 vous soit favo­rable dans vos pro­jets pro­fes­sion­nels comme per­son­nels. Si vous faites par­tie de la team "nou­velles réso­lu­tions", vous devez déjà avoir fixé votre liste. Mais si nous vous disions qu'en rajou­ter une vous ferait gagner un de nos goo­dies, ne serais-ce pas le moment…

  • Portons la bioinfo !

    Portons la bioinfo !

    On vous par­lait à la ren­trée de sep­tembre d'une sur­prise à venir sur le blog avant la fin de l'année. Eh bien juste à temps pour Noël, la voi­ci : nous ouvrons une bou­tique bioin​fo​-fr​.net ! Vous y retrou­ve­rez des goo­dies (t‑shirts, pulls, tote bag, tapis de sou­ris, etc.) avec le logo du blog, mais éga­le­ment des…

  • Le déclin (relatif) de la production bioinformatique française

    Le déclin (relatif) de la production bioinformatique française

    L’idée de cet article vient d’une étude réa­li­sée en 2008 par Jean Lobry, Pro­fes­seur à l’Université Claude Ber­nard – Lyon 1, ceci dans le cadre de ses ensei­gne­ments en bio­in­for­ma­tique (plus exac­te­ment ses TD sur le lan­gage R). Mon objec­tif était de regar­der la dyna­mique de publi­ca­tion de la France dans le domaine de la…

  • J'ai lu : Programmation en Python pour les sciences de la vie

    J'ai lu : Programmation en Python pour les sciences de la vie

    Python et la bio­in­for­ma­tique asso­ciés dans un livre, qui plus est écrit par deux maîtres de confé­rences pas­sion­nés de l'Université Paris Dide­rot que sont Patrick Fuchs et Pierre Pou­lain : nous nous devions de nous pro­cu­rer cet ouvrage et de vous en faire une rapide retrans­crip­tion ! Ce bou­quin date de juillet 2019 et c'est tout sim­ple­ment…

  • Concours : Noël avant l'heure !

    Concours : Noël avant l'heure !

    A l'occasion de la sor­tie de notre fiche de lec­ture sur le livre "Pro­gram­ma­tion en Python pour les sciences de la vie" et sur une gen­tille pro­po­si­tion de Pierre Pou­lain & Patrick Fuchs, nous vous pro­po­sons un petit jeu concours avant Noël. Pour par­ti­ci­per : il y a dans le livre un petit eas­ter egg pla­cé…

  • Génomique des paysages

    Génomique des paysages

    Introduction « Géno­mique des pay­sages » cela sonne comme le titre d’une œuvre d’Eduardo Kac. Ce nom un peu post-moderne désigne en fait une dis­ci­pline scien­ti­fique qui a connu une expan­sion ful­gu­rante au cours de la der­nière décen­nie. Les enjeux envi­ron­ne­men­taux et de conver­sa­tion actuels ont ren­dus pres­sante la néces­si­té de mieux com­prendre et décrire les espèces…

  • Sept problèmes fascinants posés par les récepteurs olfactifs

    Sept problèmes fascinants posés par les récepteurs olfactifs

    Le cinquième va vous étonner ! Introduction : l'olfaction, un sens assez bien compris et compréhensible L’olfaction n'est peut-être pas le plus noble des sens, com­pa­ré à la vue ou l’ouïe par exemple, mais il s'agit d'un sens assez bien com­pris aujourd'hui. C'est notam­ment grâce aux tra­vaux des bio­lo­gistes Lin­da B. Buck et Richard Axel, récom­pen­sés par…