• Installer Overleaf pour des documents LaTeX collaboratifs sur votre serveur

  1 septembre 2022

  -

  par

  Samuel Ortion

  dans Didacticiel

  

  Over­leaf est le suc­ces­seur de Sha­re­La­TeX, il résulte de la fusion de l'ancienne ver­sion d'Overleaf avec Sha­re­La­TeX. Il per­met d'éditer des docu­ments LaTeX en col­la­bo­ra­tif [1]. L'interface se divise en trois par­ties. Un ban­deau pour navi­guer dans les fichiers du pro­jet, un édi­teur de texte avec colo­ra­tion syn­taxique, et sug­ges­tion de com­mandes LaTeX au fur […]

  Lire la suite : Installer Overleaf pour des documents LaTeX collaboratifs sur votre serveur

• Manipulation d'intervalles génomiques dans R

  29 juin 2022

  -

  par

  Jonathan Kitt

  dans Suivez l'guide

  

  Introduction Nous avons abor­dé, dans le pré­cé­dent article de cette série, les bases de la mani­pu­la­tion d'intervalles dans R. Ce deuxième article a pour objec­tif de mon­trer com­ment mani­pu­ler des inter­valles géno­miques. Au niveau le plus basique, un inter­valle est défi­ni par deux nombres entiers posi­tifs déli­mi­tant son début et sa fin. Nous allons pou­voir […]

  Lire la suite : Manipulation d'intervalles génomiques dans R

• Putain, 10 ans !

  2 mars 2022

  -

  par

  Gwenaelle

  dans Bioinformatique

  

  Voi­là une décen­nie que ce blog existe, et même deux ans de plus pour le canal IRC qui était sa genèse ! Ce pro­jet a été ren­du pos­sible grâce à une com­mu­nau­té d'une tren­taine d'auteurs ini­tia­le­ment moti­vés pour faire décou­vrir la bioin­fo au monde fran­co­phone et répondre aux ques­tions les plus fré­quentes qu'ils pou­vaient entendre. La […]

  Lire la suite : Putain, 10 ans !

• Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

  2 février 2022

  -

  par

  Pierre Marijon

  dans Opinion

  

  Vous venez de finir votre outil sur lequel vous tra­vaillez depuis 1 semaine/​1 mois/​1 an/​10 ans (rayez la men­tion inutile) qui va révo­lu­tion­ner votre domaine. Votre code est ver­sion­né, for­ma­té, com­men­té, docu­men­té, tes­té, les résul­tats sont éva­lués selon le gold stan­dard de la dis­ci­pline sur des jeux de don­nées repré­sen­ta­tifs de la réa­li­té, votre publi­ca­tion […]

  Lire la suite : Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

• Mets ta main dans la boite

  9 novembre 2021

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Editorial

  

  Qu'il y a-t-il dans la boîte ? Spoi­ler : ça sera beau­coup moins dou­lou­reux que dans le film, c'est une pro­messe ! 🙂 Lorsque nous pro­po­sons de venir écrire sur le blog, nous avons sou­vent comme réponse "Mais je ne sau­rais même pas de quoi par­ler !".Pour­tant, cher lec­teur ou lec­trice, nous sommes per­sua­dés que ce que tu […]

  Lire la suite : Mets ta main dans la boite

• De beaux outils pour la rentrée

  7 octobre 2021

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Editorial

  Comme chaque année, le blog rentre en déca­lé pour mieux se res­sour­cer ! Nos auteurs sont à bloc et on espère voir de nom­breux contri­bu­teurs les rejoindre pour tou­jours plus d'articles de qua­li­té. Que vous soyez étu­diant, tech­ni­cien, ingé­nieur, cher­cheur, auto­di­dacte, vous pou­vez tous venir nous par­ler de votre champ de recherche, d'une nou­veau­té lue, d'un […]

  Lire la suite : De beaux outils pour la rentrée

• Introduction à la manipulation d'intervalles dans R

  7 octobre 2021

  -

  par

  Jonathan Kitt

  dans Suivez l'guide

  

  Introduction "Quelle est la pro­fon­deur de ce séquen­çage ?" "Quelle pro­por­tion de SNPs se situent dans des exons ?" "Y a-t-il des pics dans ces don­nées de ChIP-seq ?" "Quelle pro­por­tion de pro­mo­teurs che­vauchent des îlots CpG ?" Voi­là le genre de ques­tions ren­con­trées fré­quem­ment en bio­in­for­ma­tique. Nous pou­vons y répondre à l'aide de la […]

  Lire la suite : Introduction à la manipulation d'intervalles dans R

• Métabarcodes de l'ADN environnemental

  30 septembre 2021

  -

  par

  Pierre-Edouard Guerin

  dans Découverte

  

  L'une des tech­no­lo­gies en géno­mique les plus pro­met­teuses pour l'évaluation de la bio­di­ver­si­té est le méta­bar­code (de l'anglais meta­bar­co­ding) de l'ADN envi­ron­ne­men­tal (ADNe). J'ai tra­vaillé lon­gue­ment sur ces méthodes et déve­lop­pé plu­sieurs work­flows pour trai­ter et ana­ly­ser les don­nées de méta­bar­codes. J'ai notam­ment été en charge du trai­te­ment des don­nées géno­miques récol­tées par l’expédition scien­ti­fique […]

  Lire la suite : Métabarcodes de l'ADN environnemental

Articles les plus lus ces 7 derniers jours

Tests Statistiques : suivez l'guide9 octobre 2013Delphine-L

1... 2... 3... 4C ! Ou comment capturer l'état de la chromatine.28 mai 2020Émilien Nguyen

Snakemake pour les nuls (ou comment créer un pipeline facilement ?)10 mars 2016lelouar