Le blog participatif de bioinformatique francophone depuis 2012
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Une base d'articles libres pour tous niveaux
Des salons de discussion actifs au quotidien
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Qu'est-ce qu'un compartiment génomique ?
Cette question est la première que m'a posé mon jury de thèse lors de ma soutenance. Aujourd'hui, je vous propose d'y répondre le plus simplement possible. Pour comprendre cet article, il est probablement nécessaire de connaître les bases du Hi‑C, déjà résumées par votre humble serviteur en visualisation, ou en analyse sur ce blog au…
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1… 2… 3… 4C ! Ou comment capturer l'état de la chromatine.
Une cellule eucaryote comporte un noyau qui contient l’information génétique portée par les chromosomes, eux même composés d’ADN. Chez l'Homme, l'ADN des chromosomes mis bouts à bouts mesure 1,9 mètre de long. Or, tout ce matériel génétique doit tenir dans le noyau des cellules, qui lui mesure 5 à 7 micromètres de diamètre (en moyenne…
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On sort de quarantaine !
L'heure est au déconfinement partiel pour le blog également. Après une période assez chargée en changements et travail, le blog repart de plus belle. Nos auteurs ont su profiter du confinement pour vous préparer quelques articles que nous vous dévoilerons lors de ces prochaines semaines. En attendant, on vous souhaite de rester en santé et…
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Covid-19 : Des liens utiles pour aider à la recherche contre le SARS-CoV‑2
Pendant cette pandémie du Covid-19, bon nombre de personnel scientifique voudrait pouvoir apporter un peu d'aide. Voici une liste des liens qui nous sont parvenus. Covid-19 est la maladie causée par le virus SARS-CoV2, vous verrez apparaître ces deux termes dans les liens ci-bas. De l'aide à la recherche Crowd Fight Covid19 : Des scientifiques demandent…
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Blagues de bioinformaticiens
Plutôt que de vous coller un poisson en papier dans le dos en ce 1er Avril 2020 (de toute façon c'est difficile avec le confinement), je vous propose plutôt une collection de blagues dont la qualité générale n'est pas nécessairement à la hauteur de la réputation de ce blog. Un petit rébus : votre code doit…
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8 ou 2 ans ? Joyeux anniversaire le blog !
Né le 29 février 2012, le blog pourrait se targuer de faire moins que son âge 😉 Cela fait donc 8 ans que Yoann M, ZaZo0o, Malicia, et Nahoy ont fondé ce blog, 8 ans que les différents auteurs qui se sont succédés vous ont abreuvés d'articles sur une multitude de facettes de la bio-informatique !…
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La première carte de la diversité génétique des poissons publiée
Introduction En ce début d’année 2020, notre équipe* a publié la première carte mondiale de la diversité génétique des poissons d’eau de mer et d’eau douce. C’est un instrument important pour la préservation des espèces. Cette première carte est publiée dans la revue Nature Communications. Comme j’ai réalisé l’ensemble des analyses bio-informatiques, je me suis…
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Bioinformaticien•ne : un métier toujours d’avenir
Qui d’entre nous ne s’est pas un jour trouvé en situation d’expliquer son métier de bioinformaticien·ne à ses (grand-)parents/cousins/boulangers/copains d’enfance, etc. ? La Société Française de BioInformatique (SFBI) a initié en 2016 un groupe de travail sur les Métiers de la Bioinformatique (MetBif). L'objectif principal est de mieux caractériser nos métiers et de les faire…
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Contrarié par les diagrammes de Venn ? Découvrez les diagrammes UpSet
Titre incluant un moyen mnémotechnique ;D Avec ses cercles entrecroisés, on ne présente plus le célèbre diagramme de Venn. Cette représentation est utilisée dans le cas où l'on souhaite représenter le recoupement de données de nombre fini selon plusieurs variables qualitatives. De façon plus simple lorsqu'on a 2 variables qualitatives : combien d'éléments présents dans la…