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Fréquences des dinucléotides dans le génome d'organismes modèles
Lire la suite : Fréquences des dinucléotides dans le génome d'organismes modèlesL'analyse de séquences est au cœur de nombreux domaines de la bio-informatique. Le billet du jour s'intéressera aux séquences ADN, en se proposant de compter la fréquence en dinucléotides dans quelques génomes d'organismes modèles (avec une petite arrière-pensée derrière la tête). Qu'est-ce qu'un dinucléotide ? L'ADN double brins est classiquement structuré sous forme de double hélice, […]
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Bioinfo-fr.net débarque sur Discord
Lire la suite : Bioinfo-fr.net débarque sur DiscordTLDR ; pour les impatients, c'est par là : https://bioinfo-fr.net/discord On sait, on sait, ça fait des années qu'on nous répète que notre IRC c'est un truc de vieux barbus, que plus personne ne veut s'y mettre, que c'est dépassé. On y pense depuis un moment à rajouter ce nouveau canal de communication, mais il nous fallait […]
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Installer Overleaf pour des documents LaTeX collaboratifs sur votre serveur
Lire la suite : Installer Overleaf pour des documents LaTeX collaboratifs sur votre serveurOverleaf est le successeur de ShareLaTeX, il résulte de la fusion de l'ancienne version d'Overleaf avec ShareLaTeX. Il permet d'éditer des documents LaTeX en collaboratif [1]. L'interface se divise en trois parties. Un bandeau pour naviguer dans les fichiers du projet, un éditeur de texte avec coloration syntaxique, et suggestion de commandes LaTeX au fur […]
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Manipulation d'intervalles génomiques dans R
Lire la suite : Manipulation d'intervalles génomiques dans RIntroduction Nous avons abordé, dans le précédent article de cette série, les bases de la manipulation d'intervalles dans R. Ce deuxième article a pour objectif de montrer comment manipuler des intervalles génomiques. Au niveau le plus basique, un intervalle est défini par deux nombres entiers positifs délimitant son début et sa fin. Nous allons pouvoir […]
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Putain, 10 ans !
Lire la suite : Putain, 10 ans !Voilà une décennie que ce blog existe, et même deux ans de plus pour le canal IRC qui était sa genèse ! Ce projet a été rendu possible grâce à une communauté d'une trentaine d'auteurs initialement motivés pour faire découvrir la bioinfo au monde francophone et répondre aux questions les plus fréquentes qu'ils pouvaient entendre. La […]
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Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt
Lire la suite : Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txtVous venez de finir votre outil sur lequel vous travaillez depuis 1 semaine/1 mois/1 an/10 ans (rayez la mention inutile) qui va révolutionner votre domaine. Votre code est versionné, formaté, commenté, documenté, testé, les résultats sont évalués selon le gold standard de la discipline sur des jeux de données représentatifs de la réalité, votre publication […]
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Mets ta main dans la boite
Lire la suite : Mets ta main dans la boiteQu'il y a-t-il dans la boîte ? Spoiler : ça sera beaucoup moins douloureux que dans le film, c'est une promesse ! 🙂 Lorsque nous proposons de venir écrire sur le blog, nous avons souvent comme réponse "Mais je ne saurais même pas de quoi parler !".Pourtant, cher lecteur ou lectrice, nous sommes persuadés que ce que tu […]
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De beaux outils pour la rentrée
Lire la suite : De beaux outils pour la rentréeComme chaque année, le blog rentre en décalé pour mieux se ressourcer ! Nos auteurs sont à bloc et on espère voir de nombreux contributeurs les rejoindre pour toujours plus d'articles de qualité. Que vous soyez étudiant, technicien, ingénieur, chercheur, autodidacte, vous pouvez tous venir nous parler de votre champ de recherche, d'une nouveauté lue, d'un […]
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