• Putain, 10 ans !

  2 mars 2022

  -

  par

  Gwenaelle

  dans Bioinformatique

  

  Voi­là une décen­nie que ce blog existe, et même deux ans de plus pour le canal IRC qui était sa genèse ! Ce pro­jet a été ren­du pos­sible grâce à une com­mu­nau­té d'une tren­taine d'auteurs ini­tia­le­ment moti­vés pour faire décou­vrir la bioin­fo au monde fran­co­phone et répondre aux ques­tions les plus fré­quentes qu'ils pou­vaient entendre. La […]

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• Qu'est-ce qu'un bon fichier Lisez-moi.txt

  2 février 2022

  -

  par

  Pierre Marijon

  dans Opinion

  

  Vous venez de finir votre outil sur lequel vous tra­vaillez depuis 1 semaine/​1 mois/​1 an/​10 ans (rayez la men­tion inutile) qui va révo­lu­tion­ner votre domaine. Votre code est ver­sion­né, for­ma­té, com­men­té, docu­men­té, tes­té, les résul­tats sont éva­lués selon le gold stan­dard de la dis­ci­pline sur des jeux de don­nées repré­sen­ta­tifs de la réa­li­té, votre publi­ca­tion […]

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• Mets ta main dans la boite

  9 novembre 2021

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Editorial

  

  Qu'il y a‑t-il dans la boîte ? Spoi­ler : ça sera beau­coup moins dou­lou­reux que dans le film, c'est une pro­messe ! 🙂 Lorsque nous pro­po­sons de venir écrire sur le blog, nous avons sou­vent comme réponse "Mais je ne sau­rais même pas de quoi par­ler !".Pour­tant, cher lec­teur ou lec­trice, nous sommes per­sua­dés que ce que tu […]

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• De beaux outils pour la rentrée

  7 octobre 2021

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Editorial

  Comme chaque année, le blog rentre en déca­lé pour mieux se res­sour­cer ! Nos auteurs sont à bloc et on espère voir de nom­breux contri­bu­teurs les rejoindre pour tou­jours plus d'articles de qua­li­té. Que vous soyez étu­diant, tech­ni­cien, ingé­nieur, cher­cheur, auto­di­dacte, vous pou­vez tous venir nous par­ler de votre champ de recherche, d'une nou­veau­té lue, d'un […]

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• Introduction à la manipulation d'intervalles dans R

  7 octobre 2021

  -

  par

  Jonathan Kitt

  dans Suivez l'guide

  

  Introduction "Quelle est la pro­fon­deur de ce séquen­çage ?" "Quelle pro­por­tion de SNPs se situent dans des exons ?" "Y a‑t-il des pics dans ces don­nées de ChIP-seq ?" "Quelle pro­por­tion de pro­mo­teurs che­vauchent des îlots CpG ?" Voi­là le genre de ques­tions ren­con­trées fré­quem­ment en bio­in­for­ma­tique. Nous pou­vons y répondre à l'aide de la […]

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• Métabarcodes de l'ADN environnemental

  30 septembre 2021

  -

  par

  Pierre-Edouard Guerin

  dans Découverte

  

  L'une des tech­no­lo­gies en géno­mique les plus pro­met­teuses pour l'évaluation de la bio­di­ver­si­té est le méta­bar­code (de l'anglais meta­bar­co­ding) de l'ADN envi­ron­ne­men­tal (ADNe). J'ai tra­vaillé lon­gue­ment sur ces méthodes et déve­lop­pé plu­sieurs work­flows pour trai­ter et ana­ly­ser les don­nées de méta­bar­codes. J'ai notam­ment été en charge du trai­te­ment des don­nées géno­miques récol­tées par l’expédition scien­ti­fique […]

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• Choisir entre R et Python en bioinformatique ? Regards croisés entre collègues enseignants-chercheurs

  22 septembre 2021

  -

  par

  Gaëlle Lelandais

  dans Opinion

  

  Gaëlle Lelan­dais et Pierre Pou­lain Qui sommes-nous ? Tous les deux pas­sion­nés par l’enseignement, les pro­blé­ma­tiques de big data et d’analyse de don­nées en bio­lo­gie, nous nous côtoyons pro­fes­sion­nel­le­ment depuis 15 ans, avec écoute et bien­veillance. Si l’étiquette de « bio­in­for­ma­ti­cien » nous est sou­vent attri­buée, nous sommes pour­tant très dif­fé­rents. Je (Gaëlle) tra­vaille sur des pro­blé­ma­tiques de […]

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• On s'en va se reposer au soleil

  29 juillet 2021

  -

  par

  Les admin·e·s

  dans Editorial

  

  Juillet est déjà bien­tôt ter­mi­né, cer­tains de nos auteurs sont déjà en ran­don­née en mon­tagne ou les pieds dans le sable, alors il est temps de faire notre pause esti­vale ! On se revoit à la ren­trée avec tout plein de super articles qu'on a déjà en stock. Au pro­gramme : un échange d'avis sur R et […]

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