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L'analyse de données RNA-seq : mode d'emploi
Lire la suite : L'analyse de données RNA-seq : mode d'emploiUn jour, un biologiste se pointe chez vous avec d'une part un disque dur externe dans la main, d'autre part l'air soucieux. Il veut que vous analysiez ses données RNA-seq. Le disque, c'est parce qu'il a environ 50Gb de données à vous transmettre ; l'air soucieux, c'est parce qu'elles ont coûté dans les 15'000 euros, et […]
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C'est la rentrée !
Lire la suite : C'est la rentrée !Septembre est là ! Nous espérons que l'été a été bon pour vous tous et c'est en exclusivité que nous avons l'honneur et le plaisir de vous présenter enfin notre deuxième version du blog. Nous espérons du fond du cœur que les nouveautés vous plairont. Nous remercions encore une fois notre ZaZo0o qui a mis énormément […]
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Les vacances
Lire la suite : Les vacancesL'été est enfin arrivé et nous allons prendre des vacances bien méritées. Ne vous inquiétez pas, nous serons de retour en septembre avec de nouveaux articles toujours plus intéressants sur le FBA, l'EMBL ou encore un tutoriel sur l'analyse de données RNAseq, mais nous n'en dirons pas plus car ils sont encore en préparation. Nous […]
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JOBIM2013 : le bilan
Lire la suite : JOBIM2013 : le bilanÇa y est, les JOBIM 2013 ont eu lieu. Cela se passait à Toulouse au Centre des Congrès Pierre Baudis. Ce fut une semaine bien chargée et bioinformatiquement très intéressante. Les sessions plénières ainsi que les parallèles ont rencontré un certain succès. Cette année les conférenciers invités étaient au nombre de six : Simon Anders (EMBL, […]
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L'indice de Jaccard, pas qu'une histoire de mailles…
Lire la suite : L'indice de Jaccard, pas qu'une histoire de mailles…J'ai utilisé dernièrement l'indice de Jaccard pour comparer des ensembles de mots. Comme c'est une mesure assez classique et plutôt utile, j'ai décidé de vous en parler un peu. Donc voici une introduction à l'indice de Jaccard, à ne pas confondre avec le pull Jacquard, ce n'est pas du tout la même chose. L'indice de […]
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GGMM 2013 : le bilan
Lire la suite : GGMM 2013 : le bilanVotre super reporter s'est rendu à deux congrès au mois de Mai, que vous avez pu suivre en direct via des live-tweets. Pour ceux qui ont raté le coche et pour les autre aussi, voici un résumé de ce qui s'est passé durant le premier congrès. GGMM, pour Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire, est un congrès […]
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Suivez le guide : en quête de HMM
Lire la suite : Suivez le guide : en quête de HMMBases Théoriques : Une chaîne de Markov , ça vous dit quelque chose ? Une classe de modèles de Markov, appelée Modèle de Markov Caché (Hidden Markov Model, HMM), est un modèle mathématique permettant de segmenter un signal observé en régions (états cachés) définis par le modèle. Lequel est composé de quatre éléments : N états, une matrice d’émissions, des conditions […]
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Questions à… Olivier Gascuel
Lire la suite : Questions à… Olivier GascuelA la veille des Journées Ouvertes en Biologie, Informatique, Mathématiques (JOBIM), nous avons trouvé intéressant de revenir à la création de cette conférence. Pour cela, nous avons rencontré Olivier Gascuel, directeur de recherches CNRS au Laboratoire d'Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), médaille d'argent du CNRS en 2009, qui nous emmène avec lui […]
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