• ROSALIND : devenez le meilleur bioinformaticien du monde

  6 novembre 2012

  -

  par

  Yoann M.

  dans Découverte

  

  ROSALIND est un nou­veau site web com­men­çant à se faire un nom dans le milieu de la bio­in­for­ma­tique. C'est une pla­te­forme per­met­tant d’apprendre la bio­in­for­ma­tique de manière ludique en don­nant des pro­blèmes a résoudre. Chez bioin­fo-fr on aime bien et on a trou­vé judi­cieux de vous le pré­sen­ter afin que vous puis­siez vous en faire […]

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• Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

  2 novembre 2012

  -

  par

  Isabelle S. (ZaZo0o)

  dans Journal Club

  

  Après la réunion de ren­trée de tous les contri­bu­teurs du blog, nous avons déci­dé d'étendre la rubrique "Jour­nal Club". Ain­si, il est désor­mais non seule­ment pos­sible mais aus­si for­te­ment recom­man­dé de pro­po­ser des billets dis­cu­tant d'un article en par­ti­cu­lier. Nous inau­gu­rons cette exten­sion avec un sujet pas­sion­nant : la détec­tion de fac­teurs de trans­crip­tion. Bonne lec­ture […]

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• Monter un serveur de test pour des besoins d’analyses en bioinformatique

  30 octobre 2012

  -

  par

  Mica

  dans Astuce

  

  Dans cet article je vais vous par­ler d'une facette un peu moins connue de la bio­in­for­ma­tique en vous pré­sen­tant com­ment il est pos­sible, à l'heure actuelle, d'assembler un ser­veur d’analyse bio­in­for­ma­tique avec un bud­get ser­ré. Il ne s'agit pas d'une étude de mar­ché très pous­sée mais d'un simple exemple du maté­riel qu'il est pos­sible d'utiliser pour réa­li­ser un ser­veur de déve­lop­pe­ment per­for­mant. […]

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• Suivez nous sur les réseaux sociaux

  25 octobre 2012

  -

  par

  Gophys

  dans Editorial

  

  Vous ne vou­lez pas rater la sor­tie du der­nier article ? Vous vou­lez être tenus au cou­rant en temps réel des confé­rences que nous cou­vrons ? Bref vous ne pou­vez plus vous pas­ser de nous ? Ça tombe bien, vous allez pou­voir nous suivre faci­le­ment sur les réseaux sociaux et ce dès aujourd'hui. Bioin­fo-fr vient d'ouvrir un compte […]

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• Tester un système d'exploitation Unix

  23 octobre 2012

  -

  par

  Edward

  dans Découverte

  

  Un bio­lo­giste de pas­sage sur bioin​fo​-fr​.net pour­ra se deman­der com­ment tes­ter un sys­tème d'exploitation libre tel qu'Ubuntu, sachant qu'il a tou­jours tra­vaillé sous Win­dows©. Dans cet article, je donne quelques pos­si­bi­li­tés per­met­tant d'essayer gra­tui­te­ment ces sys­tèmes d'exploitations, et ce sans cham­bou­ler son ordi­na­teur et ses don­nées… Les expli­ca­tions sont acces­sibles à tous, mais s'adressent avant […]

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• ECCB — le bilan

  18 octobre 2012

  -

  par

  Article Collaboratif

  dans Conférence

  Cet article a été rédi­gé par Guillaume Col­let, Max et Yoann M. Les auteurs tiennent à remer­cier Haut­bit pour sa relec­ture et ses com­men­taires pré-publi­ca­tion. Les 8, 9, 10, 11, et 12 sep­tembre der­niers, nous étions à la confé­rence ECCB 2012 (Euro­pean Confe­rence on Com­pu­ta­tio­nal Bio­lo­gy). Nous vous pro­po­sons, un mois après, un bilan de […]

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• Les matrices de substitution

  16 octobre 2012

  -

  par

  Guillaume Collet

  dans Découverte

  

  Dans les pre­miers billets de ce blog, nous avons pré­sen­té les ali­gne­ments mul­tiples de séquences d'une part du point de vue des logi­ciels et ensuite du cal­cul de la conser­va­tion. Je vous pro­pose aujourd'hui de reve­nir sur un point impor­tant : les matrices de sub­sti­tu­tion. Com­men­çons par une défi­ni­tion très simple : une matrice de sub­sti­tu­tion per­met, […]

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• Introduction aux pipelines

  9 octobre 2012

  -

  par

  Akira

  dans Découverte

  

  Il vous est peut-être arri­vé d'attendre qu'un logi­ciel A ait fini son tra­vail pour pou­voir lan­cer un logi­ciel B, qui lui uti­lise la sor­tie du logi­ciel A. Si l'exécution de A ne prend que quelques secondes cela n'est pas trop grave. Par contre, si elle prend des heures et que vous devez véri­fier régu­liè­re­ment s’il […]

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