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Gephi pour la visualisation et l'analyse de graphes
Lire la suite : Gephi pour la visualisation et l'analyse de graphesGephi est un logiciel de visualisation et d'analyse de graphes. Il est distribué sous les licences CDDL 1.0 et GPLv3, et est disponible sur les principaux systèmes d'exploitation. Gephi est prévu d'emblée pour tous types de graphes (pas seulement en bioinformatique) dans les principaux formats. Tulip et Cytoscape sont des outils similaires. Cependant, chez moi […]
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Formaliser ses protocoles avec Snakemake
Lire la suite : Formaliser ses protocoles avec SnakemakeVous avez dit protocole ? Qui dit biologie et bioinformatique dit protocole expérimental. C'est le cœur de la démarche scientifique, et un formalisme adapté est la clef pour assurer la reproductibilité des expériences, et ainsi garantir la validation des découvertes par la communauté. En paillasse, les solutions pour formaliser et conserver les protocoles sont plutôt naturellement […]
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Jamais 2 sans 3 !
Lire la suite : Jamais 2 sans 3 !Birthday Cake | Will Clayton[/caption] C'est avec un immense plaisir que l'ensemble de l'équipe de bioinfo-fr.net souffle sa deuxième bougie cette année.Nous espérons être toujours à la hauteur de vos attentes et souhaitons bien entendu faire encore mieux dans l'avenir.Notre rythme de croisière à un article par semaine, sauf exception, est maintenant bien ancré et […]
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Il était une fois… l’analyse de séquences d’ADN
Lire la suite : Il était une fois… l’analyse de séquences d’ADNL'analyse de séquences est une mission centrale de la bioinformatique. Quelques mots sur celle de l'ADN, un domaine incontournable dans lequel les chercheurs s’attèlent à comprendre la fonction des régions régulatrices du génome et des gènes grâce aux nouvelles technologies. Le credo de la bio En biologie, il existe de nombreuses macromolécules renfermant un code permettant […]
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De l’utilité (ou pas) d’une thèse en bioinformatique
Lire la suite : De l’utilité (ou pas) d’une thèse en bioinformatique“Et pourquoi pas une thèse ?” vous êtes-vous peut-être demandé en sortant du TD de statistiques de mardi dernier. Pas forcément en biostatistiques, la thèse, hein. Mais la bioinformatique, ça vous parle vraiment. Vous adorez travailler sur des projets concrets, seul ou en groupe. Par contre, pour ce qui est de penser à l’après-Master… Certains […]
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SIB (Swiss Institute of Bioinformatics)
Lire la suite : SIB (Swiss Institute of Bioinformatics)Suite à l'article sur l'EMBL, voici la présentation d'un autre grand employeur dans le domaine de la bioinformatique. Cette fois-ci c'est un peu plus compliqué, contrairement à l'EMBL qui a ses propres bâtiments et finalement un nombre de lieux de travail réduit, le SIB, dont on va parler aujourd'hui, est réparti sur tout le territoire […]
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