• Edito d'été

  17 juillet 2012

  -

  par

  Yoann M.

  dans Editorial

  Voi­là, l'été est là ! JOBIM est pas­sée, et bien pas­sée. Nous atten­dions que le mon­tage de la vidéo de notre pré­sen­ta­tion soit fini pour pos­ter ces quelques nou­velles. Vous retrou­ve­rez donc l'intégralité de la pré­sen­ta­tion faite à JOBIM 2012 comme si vous y étiez ici et inté­gré à l'édito éga­le­ment. Un grand mer­ci à Guillaume […]

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• Récupérez facilement des données hébergées par le NCBI : BatchEntrez

  17 juillet 2012

  -

  par

  NiGoPol

  dans Astuce

  

  But : Les bases de don­nées du NCBI abritent de très nom­breuses infor­ma­tions : génomes, pro­téines, réfé­rences biblio­gra­phiques, etc. Si vous sou­hai­tez récu­pé­rer l'une d'entre-elles, une recherche sur le site est la solu­tion la plus simple, mais si vous avez besoin de récu­pé­rer de nom­breuses don­nées dans un des for­mats pro­po­sés, alors le NCBI a mis l'outil […]

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• JOBIM 2012 : le bilan

  16 juillet 2012

  -

  par

  Guillaume Collet

  dans Conférence

  

  Les Jour­nées Ouvertes Bio­lo­gie, Infor­ma­tique et Mathé­ma­tiques (JOBIM) se sont tenues du 3 au 6 juillet 2012 à l'Université de Rennes 1 et plu­sieurs membres de Bioin­fo-Fr y par­ti­ci­paient. Nous avons donc sou­hai­té vous faire par­ta­ger cette confé­rence, d'une part sur Twit­ter via le hash­tag #JOBIM2012 mais aus­si sur notre blog. Afin de rendre la […]

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• Expo virtuelle "Le génome humain et la bioinformatique"

  13 juillet 2012

  -

  par

  Malicia

  dans Découverte

  

  C'est ludique, c'est clair, c'est colo­ré, c'est inté­res­sant… Non, nous ne sommes pas devenu(e)s adeptes d'une secte, cher lec­teur. Nous venons de décou­vrir l'exposition vir­tuelle Chro­mo­so­me­Walk, lan­cée par l'Institut Suisse de Bio­in­for­ma­tique. Quand vous entrez, vous pou­vez vous "arrê­ter devant" tout chro­mo­some qui vous inté­resse. Au fil des mots, on découvre plein de choses, sou­vent […]

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• Comment travailler sur une grappe de serveurs (cluster)

  12 juillet 2012

  -

  par

  Akira

  dans Astuce, Découverte

  

  Avec les avan­cées en bio­lo­gie ces der­nières années, la quan­ti­té de don­nées pro­duites et les res­sources infor­ma­tiques néces­saires à leur trai­te­ment ont gran­de­ment aug­men­té. Pour faire face à ces pro­blèmes, l'une des solu­tions les plus répan­dues est la mise en place de grappes de ser­veurs (plus sou­vent dési­gnées par le terme anglais com­pu­ter clus­ter ou […]

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• J’ai lu : Bioinformatique – Génomique et post-génomique

  11 juillet 2012

  -

  par

  nallias

  dans J'ai lu

  

  Suite à l'article de Guillaume, voi­ci le deuxième article de la rubrique J’ai lu, por­tant sur le livre « Bio­in­for­ma­tique – Géno­mique et post-géno­mique ». Bioinformatique – Génomique et post-génomique Ouvrage de Fré­dé­ric Dar­del et Fran­çois Képès, pro­fes­seurs à l'École poly­tech­nique, publié en 2002 aux Édi­tions École poly­tech­nique. Une par­tie de l’œuvre est dis­po­nible sur google docs. © Édi­tions École […]

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• Les éléments transposables : de l’appellation "ADN poubelle" à leur étude.

  2 juillet 2012

  -

  par

  Hautbit

  dans Découverte

  

  Les élé­ments trans­po­sables sont des séquences d'ADN mobiles dont l'existence à été mise en évi­dence par Bar­ba­ra McClin­tock dans les années 40 chez le maïs. Ces séquences sont pré­sentes dans toutes les branches de l'arbre du vivant et peuvent repré­sen­ter une grande par­tie du génome (envi­ron 40% du génome chez l'Homme et jusqu'à 90% chez […]

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• Introduction à Circos

  26 juin 2012

  -

  par

  Mica

  dans Découverte

  

  La visua­li­sa­tion de don­nées est un pro­blème récur­rent dans un grand nombre de dis­ci­plines. En bio­in­for­ma­tique, il est sou­vent dif­fi­cile de repré­sen­ter de manière effi­cace des quan­ti­tés mas­sives de don­nées. Une « bonne » repré­sen­ta­tion gra­phique doit être adap­tée au type de don­nées que l’on sou­haite visua­li­ser et sur­tout aux résul­tats que l’on sou­haite mettre en évi­dence. Par […]

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