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Introduction à l'analyse d'images
Lire la suite : Introduction à l'analyse d'imagesCe nouvel article a pour but de donner une brève introduction à l’analyse d’images numériques en bioinformatique. Je préfère prévenir tout de suite, je ne suis pas expert en la matière mais c’est un domaine que je trouve très intéressant et dont il est toujours utile d’avoir quelques notions, pour retoucher vos magnifiques photos de […]
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Astuce programmation BioPython : Parser les multi-genbank et les multi-FASTA produits par Batch Entrez
Lire la suite : Astuce programmation BioPython : Parser les multi-genbank et les multi-FASTA produits par Batch EntrezPrérequis : Savoir 'un peu' se servir d'un shell et avoir installé Python et son module Bio. But : Redécouper des multi-genbank ou des multi-FASTA en un fichier par entrée. Difficulté : 2/5 (Facile) Principe : Le NCBI propose un outil très pratique pour récupérer facilement des jeux de données diversifiés : BatchEntrez, vous trouverez plus d'information ici. On télécharge ainsi un […]
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Les arbres phylogénétiques : construction et interprétation
Lire la suite : Les arbres phylogénétiques : construction et interprétationAprès avoir discuté des alignements multiples (MSA), il s'avérait logique de vous présenter l'étape suivante : la construction d'arbres phylogénétiques. Je précise que je ne parlerai ici que de phylogénie moléculaire. Le but de la phylogénie est de comprendre les relations de parenté, de retracer l’historique évolutif d’un gène, d’une famille de gènes ou d’une espèce. Les […]
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La nouvelle mode d'été : Journal Club au bord de la piscine
Lire la suite : La nouvelle mode d'été : Journal Club au bord de la piscineComme vous l'avez certainement remarqué, le Journal Club du mois dernier n'a pas eu lieu. Je sais que vous en êtes profondément affligé(e)s, donc à charge de revanche, j'ai inclus des articles du mois passé. Il y a un peu plus de mots que d'habitude, mais quand on aime, on ne compte pas ! Et parce […]
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Base de données — notions
Lire la suite : Base de données — notionsCet article a pour but d'introduire la notion de base de données. Il sera utile pour toute personne ayant déjà entendu le terme, mais ne sachant pas vraiment ce que c'est, ou à quoi cela sert. Définition Une base de données c'est tout simplement une collection d'informations diverses stockées de manière pérenne sur un ordinateur. […]
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De l'intérêt des disciplines transversales
Lire la suite : De l'intérêt des disciplines transversalesLa bioinformatique fait partie de ce qu'on appelle les disciplines transversales, ces disciplines qui forment un trait d'union entre les disciplines dites classiques. Avec l'avancée des nouvelles technologies et l'étendues des connaissances qu'elles permettent d'acquérir, il devient de plus en plus nécessaire de repenser les différents domaines scientifiques, tant leur cloisonnement historique perd en pertinence. […]
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