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Fabriquer un trackhub dans UCSC
Lire la suite : Fabriquer un trackhub dans UCSCJ'ai décidé de partager avec vous la petite astuce du moment que j'ai découverte grâce à Jonathan et que j'ai incorporée dans mon travail actuel (merci encore à lui, il a lu toute l’infâme documentation de UCSC). Le navigateur génomique (pour ne pas dire genome browser) de UCSC nous autorise donc à générer et visualiser […]
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Un bookmarklet pour accéder plus facilement aux publications
Lire la suite : Un bookmarklet pour accéder plus facilement aux publicationsSi vous êtes au CNRS, ou à l'Inserm, vous êtes probablement familiers avec BiblioInserm ou BiblioVIE, les portails d’informations et d’accès aux revues de ces institutions. Le portail BiblioInserm Le portail BiblioVIE Ces portails vous permettent d’accéder par exemple à PUBMED et d’y chercher des articles, sous réserve d’avoir un identifiant et le mot […]
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Julia : le successeur de R ?
Lire la suite : Julia : le successeur de R ?Actuellement le langage R est incontournable pour qui veut manipuler des données en bioinformatique, en particulier pour l'analyse statistique. Mais un successeur est en passe de s'imposer : Julia, combinant puissance du langage avec les fonctionnalités de R, et comblant les nombreux défauts de ce dernier — mais plus encore ! Voici une présentation de ce tout […]
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Analyses rapides de fichiers
Lire la suite : Analyses rapides de fichiersLangage : shell, sous GNU/Linux Commandes présentées :wc, awk, sed, tr, head, nl, cut Niveau : débutant Dans le cadre de notre travail, nous sommes souvent amenés à manipuler de nombreux fichiers contenant des milliers de lignes et des dizaines de champs. Dans ces cas-là, nous avons souvent tendance à virer à la paranoïa et à vouloir nous […]
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Tests Statistiques : suivez l'guide
Lire la suite : Tests Statistiques : suivez l'guideIntroduction : Pourquoi des tests statistiques ? Les tests statistiques sont de puissants outils d’aide à la décision pour le chercheur, qui lui permettent de vérifier des hypothèses expérimentales, avec un certain seuil de probabilité. Ces tests sont simples à appliquer, mais parfois moins simples à comprendre. C’est pourquoi nous allons étudier ensemble ces tests pas à pas […]
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Questions à… Virginie Martiny
Lire la suite : Questions à… Virginie MartinyC'est la rentrée, les vacances sont terminées et les étudiants reprennent le chemin des bancs de la fac, tandis que les enseignants-chercheurs repassent devant le tableau noir pour transmettre leurs connaissances. C'est aussi la période où une partie des étudiants franchissent la dernière ligne droite : la remise du manuscrit de thèse et la soumission devant […]
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