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Command line Tips : passage de variable dans awk
Lire la suite : Command line Tips : passage de variable dans awkBut : Dans un fichier organisé en colonnes, nous allons extraire les lignes contenant un mot (donné en argument) dans une colonne fixée à l'avance (1ère colonne). Prérequis : Connaître un peu le shell (pour l'exercice). Difficulté : 2/5 (Facile) Exercice : Pour agrémenter la note, on extraira dans quatre fichiers distincts les lignes contenant les quatre mots les […]
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Bioconductor
Lire la suite : BioconductorBioconductor Voilà le sujet que l'on va aborder ensemble aujourd'hui. On va voir ce que c'est, à quoi cela sert, comment l'installer et bien-sûr l'utiliser. Qu'est-ce donc ? Je décrirais Bioconductor comme un projet participatif. Il est libre d'accès et son développement dépend de ce que la communauté veut bien y apporter. L'objectif est simple, offrir […]
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Edito — Un peu de nouvelles
Lire la suite : Edito — Un peu de nouvellesLe mois de juin est maintenant bien entamé, nous gardons notre vitesse de croisière et espérons que cela vous convient toujours. JOBIM arrive à grand pas, nous remercions d'ailleurs les organisateurs qui nous offrent du temps de parole pendant l'événement. Nous travaillons actuellement sur la présentation qui sera faite là-bas et nous vous encourageons vivement […]
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Data Visualisation ou l'art de se faire comprendre
Lire la suite : Data Visualisation ou l'art de se faire comprendreDe nos jours il faut comprendre et se faire comprendre vite et bien. Une bonne présentation, un bon article ou bien un bon poster se distingue non seulement par un contenu pertinent mais aussi par des illustrations efficaces. On peut avoir la meilleure idée du monde, si on ne sait pas la mettre en valeur […]
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SQL Tips : Les transactions
Lire la suite : SQL Tips : Les transactionsBut : Comprendre ce qu'est une transaction au sens SQL du terme, savoir l'utiliser : les avantages, les limitations. J'aborderai superficiellement la notion de degré d'isolation. Prérequis : Savoir faire des requêtes. Difficulté : 1 (Facile) Tout d'abord une définition volontairement simple : une transaction est un ensemble d'une ou plusieurs requêtes SQL regroupées au sein d'un bloc qui est […]
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Le séquençage, une histoire de générations
Lire la suite : Le séquençage, une histoire de générationsL'ADN (Acide DésoxyriboNucléique) est une molécule présente dans toutes les cellules des êtres vivants. Elle renferme l'information nécessaire pour se développer et se reproduire. L'information en elle-même est codée par la suite de quatre différents acides nucléiques ordonnés d'une façon compréhensible pour l'organisme. Décrypter cette information est un enjeu majeur pour la recherche scientifique. Il […]
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TurboGears, petite mise en bouche
Lire la suite : TurboGears, petite mise en boucheTurboGears, Django ou encore Ruby on Rails. Qui n'a jamais entendu parler d'un de ces Frameworks Web de nos jours ? Mais vous y êtes-vous déjà intéressé un peu de plus près ? Cet article sera l'occasion de s'y mettre par exemple ! Késako ? Commençons donc par le commencement : qu'est ce qu'un "web meta framework" ? C'est un […]
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La modélisation moléculaire
Lire la suite : La modélisation moléculaireLa modélisation moléculaire est un ensemble de méthodes permettant d'expliquer comment fonctionne le vivant. En effet, le vivant est une succession d’interactions entre différentes molécules : protéines, ADN, ARN, membranes, etc. Ces molécules interagissent les unes par rapport aux autres en fonction de plusieurs paramètres : leurs formes, leurs propriétés chimiques et leur environnement. La modélisation moléculaire permet de prédire la […]
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