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Jouer avec l'API de KEGG
Lire la suite : Jouer avec l'API de KEGGIl n'est pas rare que nous ayons un jour besoin de récupérer des informations de la base de données KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). Cette base de données fournit un nombre conséquent d'informations sur les génomes et les réseaux de gènes mais également sur les voies métaboliques ou les maladies. Dans ces cas […]
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Petite introduction sur… les éléments répétés
Lire la suite : Petite introduction sur… les éléments répétésSuite à l'excellent billet proposé par un autre auteur du blog, de nombreuses questions sur ce que sont les éléments répétés sont restées en suspens. Après le séquençage du génome humain dans les années 2000, de nombreux chercheurs ont constaté que la majeure partie du génome n'était pas composée de gènes, mais d'ADN à l'époque […]
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LaTeX : la mise en forme du texte et des paragraphes
Lire la suite : LaTeX : la mise en forme du texte et des paragraphesBon maintenant qu'on sait compiler et insérer des flottants, un truc critique à voir c'est comment mettre en forme : mettre en italique, en emphase, en gras, souligner, faire des listes à puces, insérer du code… Préparez-vous, ça risque d'être un peu long :). (Et par un peu long je veux aussi dire un peu enquiquinant, […]
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Au boulot !
Lire la suite : Au boulot !Comme diraient quelques personnes de petites tailles mondialement connues : "♫ Eh oh, eh oh, on s'en va au boulot ! ♫ ". Car oui, c'est aujourd'hui la reprise chez bioinfo-fr.net ! On espère vous avoir manqué (un peu) et que ce qu'on vous a préparé pour la rentrée vous satisfera ! Le planning de publication a été refait, […]
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Vacances bien méritées !
Lire la suite : Vacances bien méritées !Comme chaque année le blog se met en pause estivale durant le mois d'août, on en profite pour aller faire bronzer nos claviers 🙂 Nous vous remercions toutes et tous pour vos encouragements. Vous êtes chaque semaine de plus en plus nombreuses et nombreux à nous suivre. N'hésitez pas à venir rejoindre l'équipe si vous […]
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Les éléments répétés du génome humain : aperçu rapide avec R et le tidyverse
Lire la suite : Les éléments répétés du génome humain : aperçu rapide avec R et le tidyverseDans un précédent article, nous avions regardé le fichier d'annotation des gènes du génome humain d’après Gencode. J'avais utilisé pour cela la puissante combinaison dplyr + ggplot2 (packages centraux du tidyverse), particulièrement adaptée à tout ce qui est manipulation et visualisation de données tabulaires. Mais notre génome n'est pas constitué que de gènes, loin s'en […]
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Le site du NCBI "un peu" plus moderne grâce aux extensions de navigateurs
Lire la suite : Le site du NCBI "un peu" plus moderne grâce aux extensions de navigateurs« Pour la semaine prochaine vous allez devoir trouver et étudier l’article sur le site du NCBI [insérer un nom bien compliqué ici] » Passée la déception d’avoir à se plonger dans un article obscur en anglais, on ouvre l’article en question et là… on découvre un énorme pavé de texte ma foi fort intéressant mais […]
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Créez vos documents collaboratifs en LaTeX
Lire la suite : Créez vos documents collaboratifs en LaTeXAujourd'hui, on vous présente une méthode pour créer vos documents collaboratifs en ligne, en utilisant LaTeX, ainsi que quelques astuces qui pourront peut-être vous simplifier la vie ! Un petit peu de contexte Imaginons : vous êtes un jeune chercheur dynamique, et vous voulez rédiger un papier avec vos collaborateurs. Ou bien vous êtes un étudiant, et […]
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