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Vacances bien méritées !
Lire la suite : Vacances bien méritées !Comme chaque année le blog se met en pause estivale durant le mois d'août, on en profite pour aller faire bronzer nos claviers 🙂 Nous vous remercions toutes et tous pour vos encouragements. Vous êtes chaque semaine de plus en plus nombreuses et nombreux à nous suivre. N'hésitez pas à venir rejoindre l'équipe si vous […]
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Les éléments répétés du génome humain : aperçu rapide avec R et le tidyverse
Lire la suite : Les éléments répétés du génome humain : aperçu rapide avec R et le tidyverseDans un précédent article, nous avions regardé le fichier d'annotation des gènes du génome humain d’après Gencode. J'avais utilisé pour cela la puissante combinaison dplyr + ggplot2 (packages centraux du tidyverse), particulièrement adaptée à tout ce qui est manipulation et visualisation de données tabulaires. Mais notre génome n'est pas constitué que de gènes, loin s'en […]
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Le site du NCBI "un peu" plus moderne grâce aux extensions de navigateurs
Lire la suite : Le site du NCBI "un peu" plus moderne grâce aux extensions de navigateurs« Pour la semaine prochaine vous allez devoir trouver et étudier l’article sur le site du NCBI [insérer un nom bien compliqué ici] » Passée la déception d’avoir à se plonger dans un article obscur en anglais, on ouvre l’article en question et là… on découvre un énorme pavé de texte ma foi fort intéressant mais […]
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Créez vos documents collaboratifs en LaTeX
Lire la suite : Créez vos documents collaboratifs en LaTeXAujourd'hui, on vous présente une méthode pour créer vos documents collaboratifs en ligne, en utilisant LaTeX, ainsi que quelques astuces qui pourront peut-être vous simplifier la vie ! Un petit peu de contexte Imaginons : vous êtes un jeune chercheur dynamique, et vous voulez rédiger un papier avec vos collaborateurs. Ou bien vous êtes un étudiant, et […]
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Virtualisez pour plus de reproductibilité
Lire la suite : Virtualisez pour plus de reproductibilitéVirtualisez pour plus de reproductibilité Pour commencer Vous avez entendu parler de reproductibilité. Vous voulez vous y mettre ? Vous vous dites que la virtualisation vous aiderait à utiliser toujours la même version d'un outil précis. En savoir plus sur Docker vous aiderait bien ? Cet article est donc pour vous. Je profite de l'occasion pour parler […]
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Pimp my workstation : avoir le terminal le plus classe du bureau !
Lire la suite : Pimp my workstation : avoir le terminal le plus classe du bureau !Mise en place de zsh et d'un dossier .dotfiles Introduction Qu'est-ce que c'est que zsh ? Il s'agit (comme nous indique aimablement sa page Wikipédia) d'un shell unix. En gros, il s'agit d'un remplaçant potentiel pour votre vénérable interpréteur bash. Mais pourquoi se casser le beignet à installer zsh, alors que j'ai déjà bash ? zsh a […]
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We are still alive !
Lire la suite : We are still alive !Cela faisait trop longtemps que nous n'avions pas posté de nouvel édito !Pour faire court : Très bon ensoleillement à tous !
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Questions à… Jean-Marc Victor
Lire la suite : Questions à… Jean-Marc VictorRetranscription de la Table Ouverte en bioinformatique (TOBi) du mois d'avril 2017 avec Jean-Marc Victor, directeur de recherche CNRS au LPTMC et responsable du GdR ADN. Pouvez-vous vous présenter ?Jean-Marc Victor : Je ne suis pas bioinformaticien. Je suis un peu bio, mais pas trop informaticien. Et je suis physicien. Et il parait que c'est la première fois […]
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