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Cartographie des formations en bioinformatique en France
Lire la suite : Cartographie des formations en bioinformatique en FranceL'origine du projet : Dans le cadre d'un projet tutoré du master de Bioinformatique de Rennes, nous avons mis en place un pipeline d'analyse des mails envoyés par la SFBI durant l'année 2014. Plusieurs modules ont été développés sous la forme de scripts Python, par un ou plusieurs étudiants. Je me chargeais de développer un module capable de générer des cartes […]
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S'outiller et s'organiser pour mieux travailler
Lire la suite : S'outiller et s'organiser pour mieux travaillerTL;DR La reproductibilité, c’est la vie (dans le monde scientifique) ! Tout résultat doit pouvoir être reproduit. La technologie permet de faciliter la recherche de reproductibilité. Les cahiers de laboratoire papiers ne sont plus du tout adaptés à la recherche actuelle et au besoin de reproductibilité. Je préconise donc d’utiliser git et GitHub, de bien […]
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Questions à… Laurent Mouchard
Lire la suite : Questions à… Laurent MouchardAvec un peu beaucoup de retard, retrouvez la retranscription de la TOBi organisée par JeBiF en mai 2016 avec Laurent Mouchard, maître de conférence à l'Université de Rouen et modérateur de la liste bioinfo. Nous le remercions d'être venu nous raconter la petite histoire de la bioinformatique ! . Laurent Mouchard : Je suis vieux… J'ai donc eu le temps […]
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Automne 2016
Lire la suite : Automne 2016L'automne est là, le deuil de l'été est maintenant fait et nous sommes prêts à finir l'année en beauté. De beaux articles sont en préparation et de ce qu'on a déjà vu, ça promet d'être du lourd ! En parallèle, nous avons pour projet d'enrichir l'expérience bioinfo-fr.net. Forts de nos quelques années d'existence, nous avons maintenant […]
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C'est l'enfeR.
Lire la suite : C'est l'enfeR.Certains bio-informaticiens ne jurent que par R (j'en fais partie). Je suis amoureux de sa simplicité (sic), son élégance (re-sic), sa documentation et ses innombrables packages tous plus utiles les uns que les autres. Et surtout c'est le seul langage que je maîtrise un peu convenablement, alors forcément je trouve tous les autres langages nuls, […]
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Team Pétanque !
Lire la suite : Team Pétanque !L'été est enfin là et bien là, du coup nous allons en profiter pour faire notre pause annuelle de publications. Nous vous avons produit tout un tas d'articles que vous pourrez lire et re-lire sur la plage entre deux Galas, même si, disons-le tout de suite, Bioinfo-Fr est plus cool à consulter 🙂 ! Vous […]
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Ajoutez une interface graphique à votre script en 4 lignes avec Gooey
Lire la suite : Ajoutez une interface graphique à votre script en 4 lignes avec GooeyVous venez de terminer votre analyse bio-informatique. Pour cette dernière, vous avez réalisé un script qui pour l'instant, il faut le dire, n'est pas du tout réutilisable par une tierce personne. Même vous dans 6 mois vous n'êtes pas sûr de vous souvenir de ce que vous avez fait. Pourtant, l'un des intérêts de la […]
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