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2017, on y est !
Lire la suite : 2017, on y est !L'ensemble de l'équipe de bioinfo-fr.net vous souhaite une excellente année 2017 et plein de réussites pro et perso (oui, on a attendu le dernier jour de janvier pour vous dire ça 🙂 ). Nous avons prévu quelques nouveautés à venir dans le courant de l'année. Nous essayons de faire au mieux et au plus rapide […]
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dplyr et le génome humain
Lire la suite : dplyr et le génome humainIntroduction Non, ne fuyez pas tout de suite, chers lecteurs, tout va s'éclaircir : dplyr, c’est plyr pour les data.frame (les tableaux de données). Attendez, j’y viens, plyr, c’est un package R pour appliquer (apply) des fonctions. Donc, dplyr (prononcez “diplir”), c’est un package R, pour appliquer des fonctions à un tableau de données. Et ça, […]
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Nowel approche…
Lire la suite : Nowel approche…… et avec lui son lot de festivités et festins en tout genre à venir ! Le blog s'est encore enrichi cette année de nombreux et beaux articles, et ce grâce à la participation de tous nos auteur.e.s et relecteur.trice.s toujours au top ! Merci à eux pour leur travail. Et si jamais vous, oui vous qui […]
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La magie de LXD
Lire la suite : La magie de LXDÉcrire un pipeline en bioinformatique, c'est bien ! Le rendre portable c'est encore mieux ! Les bioinformaticiens oublient souvent ce dernier point et rare sont les pipelines qui marchent du premier coup. À vrai dire les circonstances ne sont pas en leur faveur. Un pipeline c'est plein de dépendances d'applications dans telle ou telle version, qu'il faut […]
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LaTeX : le premier document !
Lire la suite : LaTeX : le premier document !On s'est rendu compte sur #bioinfo-fr et sur #jebif (les canaux IRC sur freenode) qu'au cours des rédactions de rapports de stage ou même de thèse on avait plein de questions portant sur LaTeX et on a décidé qu'on allait se fendre de quelques articles sur LaTeX pour avoir une suite de liens appropriés à […]
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Automatiser la récupération de données biologiques : version avancée
Lire la suite : Automatiser la récupération de données biologiques : version avancéeDans cette version avancée, nous allons nous intéresser à une autre manière de récupérer des données depuis un site internet : via l'utilisation de formulaires. Les formulaires, ce sont ces pages avec plein de champs à remplir et que vous soumettez ensuite pour vous créer un compte, contacter votre hotline ou que sais-je. Leur utilisation permet […]
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AMBB : Colloque « Les futurs de la bio-informatique »
Lire la suite : AMBB : Colloque « Les futurs de la bio-informatique »L’Association du Master Bio-informatique de Bordeaux (AMBB) organise son premier colloque sur la thématique : « Les futurs de la bio-informatique ». Il aura lieu Jeudi 08 Décembre 2016 de 13H à 17H30 dans l’amphithéâtre B du bâtiment A29 sur le campus de Talence de l’Université de Bordeaux (351 Cours de la Libération, 33800 Talence). Cette demi-journée a […]
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Nextflow, pour votre prochain pipeline ?
Lire la suite : Nextflow, pour votre prochain pipeline ?Pour commencer Vous savez déjà tout sur les pipelines et les bonnes pratiques de développement. Vous faites bien évidemment de la recherche reproductive. Vous travaillez peut-être avec un cluster. Vous avez écrit votre propre pipeline en Bash, Python ou même en Perl qui gérait les appels à différents scripts et outils (voire même l'appel à […]
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