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Analyse de réseaux : du degré des noeuds aux centralités
Lire la suite : Analyse de réseaux : du degré des noeuds aux centralitésLe deuxième article sur la représentation du métabolisme et son analyse ! Pour rappel, le premier volet est ici ! Un grand nombre de phénomènes biologiques peuvent être représentés sous la forme d'un réseau. Qui n'a jamais entendu parler de réseaux d'intéraction protéine-protéine (fameux réseaux "PPI"), de réseaux de gènes ou encore de réseaux métaboliques ? En fait, […]
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État de l'emploi bioinformatique en France : analyse des offres de la SFBI (2ème partie)
Lire la suite : État de l'emploi bioinformatique en France : analyse des offres de la SFBI (2ème partie)Nous revoilà pour la suite de notre premier article sur l'analyse des offres de la SFBI. On vous avait promis une analyse de l'évolution du marché, et c'est ce dont nous allons parler dans cet article. Je vous renvoie au premier article si vous voulez plus d'informations sur l'origine des données et la disponibilité du […]
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Software Carpentry ou la transmission de bonnes pratiques en informatique
Lire la suite : Software Carpentry ou la transmission de bonnes pratiques en informatiqueAvec l’augmentation de la capacité des ordinateurs et de la qualité des algorithmes, l’informatique prend une place de plus en plus importante dans la vie de tous les jours, mais aussi dans la recherche. Cela est rendu aussi possible grâce à la programmation et aux améliorations des languages, des outils et des pratiques. Les développeurs sont […]
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Snakemake aller plus loin avec la parallélisation
Lire la suite : Snakemake aller plus loin avec la parallélisationBonjour à tous, bienvenue dans un nouvel épisode de tutoriels sur Snakemake (épisode précédent). Aujourd'hui nous allons voir ensemble comment paralléliser facilement par la donnée grâce à Snakemake. L'idée générale consiste à découper les fichiers bruts au début de notre pipeline et de les rassembler après les étapes lourdes en calcul. Nous allons également voir comment […]
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Le Master de Bordeaux s'internationalise !
Lire la suite : Le Master de Bordeaux s'internationalise !Le Master Bioinformatique de Bordeaux propose à présent 3 parcours, dès la rentrée 2016-2017 : Le parcours "Biologie Computationnelle" est centré sur l'acquisition de compétences en développement logiciel et les méthodologies de gestion de données incluant la modélisation, la simulation de processus et l'analyse d'images biologiques. Le parcours "Du Génome aux Ecosystèmes" est focalisé sur l'utilisation […]
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JOBIM2016 : BioInfuse
Lire la suite : JOBIM2016 : BioInfuseUn petit édito car : le dernier commençait à dater ; nous voulions vous annoncer que nous serons à JOBIM2016, et qu'on aura même un magnifique poster à vous présenter. Donc n'hésitez surtout pas à venir nous offrir une bière interpeller ; on voulait aussi vous signaler l'existence du concours BioInfuse proposé par nos copains de JeBiF. Le […]
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Introduction à l'analyse des SNPs
Lire la suite : Introduction à l'analyse des SNPsIntroduction Un SNP (Single Nucleotid Polymorphism) est la mutation d'un seul nucléotide à une position donnée, entre individus d'une même population. Ces substitutions ponctuelles permettent d'identifier des sous-populations. Vous avez sûrement étudié en cours l'exemple de la drépanocytose, une maladie causée par la mutation ponctuelle d'un gène. L'origine de cette maladie génétique peut être observée en […]
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