• Questions à… Gabriel Chandesris

  18 mai 2016

  -

  par

  Gwenaelle

  dans Entretien

  

  Comme chaque mois à pré­sent, retrou­vez la retrans­crip­tion du TOBi orga­ni­sé par JeBiF.   Gwe­naëlle Lemoine (Gwe­naëlle L.) : Bon­jour Gabriel, nous sommes ravis de te rece­voir pour ce 4ème TOBi !  Tu tra­vailles actuel­le­ment chez Das­sault Sys­tèmes et plus pré­ci­sé­ment Bio­via mais n'en dévoi­lons pas plus. Je te laisse nous pré­sen­ter ta for­ma­tion, ton par­cours pro­fes­sion­nel […]

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• Introduction à la structure secondaire des ARN

  11 mai 2016

  -

  par

  Maria Pommeret

  dans Découverte

  

  Quand j'étais étu­diante en mas­ter, la grande majo­ri­té des cours de struc­ture étaient réser­vés aux pro­téines, ce qui fait que la struc­ture des ARN n'a pas été très déve­lop­pée au cours de mon cur­sus. Du coup, je vous livre ici une par­tie de ce que j'ai appris en stage. Défi­ni­tion 0 : ARN L'ARN (acide ribo­nu­cléique) est […]

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• Généralité autour du concept de machine learning à partir d'automate

  4 mai 2016

  -

  par

  Léopold Carron

  dans Découverte, Opinion

  

  Pour beau­coup de per­sonnes, le machine lear­ning consiste à apprendre un clas­si­fieur de don­nées. Un exemple d'application prin­ci­pal serait d'être capable de dif­fé­ren­cier de manière auto­ma­tique plu­sieurs varié­tés d'iris selon la taille de leurs pétales. Mais selon moi, le machine lear­ning repré­sente beau­coup plus : c'est une science qui per­met d'expliquer à un ordi­na­teur com­ment réa­li­ser une tâche d'apprentissage […]

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• Champs de force, énergie potentielle et autres joyeusetés en modélisation moléculaire

  28 avril 2016

  -

  par

  wj

  dans Découverte, Didacticiel

  

  Introduction Cet article, d'une très longue série, a pour but de don­ner plus de détails et peut-être - qui sait - vous titiller suf­fi­sam­ment pour enjam­ber la bar­rière phy­sique (au sens lit­té­ral) et rejoindre le fabu­leux monde d'Oz de la bio­in­for­ma­tique struc­tu­rale. Avant de com­men­cer, je vous conseille de prendre du papier, un crayon, un […]

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• Automatiser la récupération de données biologiques

  20 avril 2016

  -

  par

  Fabrice Jossinet

  dans Didacticiel

  

  Qui dit bio­in­for­ma­tique, dit récu­pé­ra­tion et mani­pu­la­tion des don­nées. Ces don­nées peuvent être géné­rées à par­tir d'algorithmes ou bien récu­pé­rées depuis des bases de don­nées bio­lo­giques. Aujourd'hui, le nombre de ces bases de don­nées est en constante aug­men­ta­tion. Chaque méca­nisme bio­lo­gique, famille molé­cu­laire ou orga­nisme est asso­cié à un ou plu­sieurs de ces dépôts de don­nées. Si un […]

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• Questions à… Sophie Schbath

  13 avril 2016

  -

  par

  Gwenaelle

  dans Entretien

  

  Ca y est ! Le concept des Tables Ouvertes en Bio­In­for­ma­tique (TOBi), petit des­cen­dant des feus JeBiF Pub Paris, com­mence à bien s’implanter ! Un rapide rap­pel du concept pour les retar­da­taires : tous les deuxièmes jeu­di du mois au Café Six, retrou­vez autour d'un verre l'association JeBiF et son invi­té du jour qui vien­dra pré­sen­ter ses tra­vaux, son […]

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• Au détour d'une ruelle

  11 avril 2016

  -

  par

  Gwenaelle

  dans En image

  

     

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• Représenter le métabolisme - les réseaux métaboliques

  7 avril 2016

  -

  par

  Bunny

  dans Découverte

  

  *grosse voix très sérieuse* Atten­tion ! L'article qui suit est le pre­mier d'une série d'articles sur la repré­sen­ta­tion du méta­bo­lisme sous forme de réseaux et leur ana­lyse. Il existe, en bio­in­for­ma­tique, plu­sieurs caté­go­ries de modèles pour décrire le méta­bo­lisme.Tout d’abord, les modèles pour l’ana­lyse struc­tu­relle du méta­bo­lisme. Cette caté­go­rie regroupe prin­ci­pa­le­ment les modèles repo­sant sur la théo­rie […]

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