• Trouver un emploi/​une thèse en bioinformatique : quelques pistes

  24 mai 2012

  -

  par

  Estel

  dans Astuce, Formation

  

  Par­mi les lec­teurs de Bioin­fo-fr, il y a très pro­ba­ble­ment des étu­diants de M2 qui, absor­bés par leur stage de fin d'année, n'ont pas encore vrai­ment réflé­chi à ce qu'ils vou­draient faire à la ren­trée ; des thé­sards dont la sou­te­nance approche et qui aime­raient faire un post-doc à l'étranger ; ou encore des ingé­nieurs dont le […]

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• Bien commencer en bioinformatique

  23 mai 2012

  -

  par

  Aurélien C.

  dans Découverte

  

  "Je n'y connais rien en infor­ma­tique", "C'est trop com­pli­qué pour moi" ou "Je ne sais pas par où com­men­cer" sont des phrases qui nous servent sou­vent d'excuse pour ne pas nous lan­cer dans le grand bain de la bio­in­for­ma­tique. Bio­lo­giste de for­ma­tion, j'ai moi-même à plu­sieurs reprises repous­sé l'échéance avant de sau­ter, ne sachant com­ment […]

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• Filtre de Bloom

  18 mai 2012

  -

  par

  Nico M.

  dans Découverte

  

  Comme vous le savez sans doute, la géno­mique tend à géné­rer de plus en plus de don­nées grâce à une forte réduc­tion des coûts (cf gra­phique ci des­sous). Depuis peu de temps, la géné­ra­tion des don­nées n’est plus for­ce­ment le point limi­tant d’une étude, mais c’est l’analyse des don­nées qui devient vrai­ment longue et coû­teuse. […]

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• J'ai lu : Bioinformatique — Principe d'utilisation des outils

  16 mai 2012

  -

  par

  Guillaume Collet

  dans J'ai lu

  

  Dans l'édito du mois de mai, nous vous avons pro­mis une nou­velle rubrique J'ai lu. Et donc, le mois der­nier, j'ai lu pour vous "Bio-infor­ma­tique — Prin­cipes d'utilisation des outils" dont voi­ci la revue. Bioinformatique Principes d'utilisation des outils Ouvrage coor­don­né par Denis Tagu et Jean-Loup Ris­ler, publié en 2010 aux édi­tions Quæ dans la col­lec­tion Savoir […]

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• À la découverte de BioMart !

  10 mai 2012

  -

  par

  Nolwenn

  dans Découverte

  

  Dans le cadre de mon tra­vail, j'ai récem­ment décou­vert un outil for­mi­dable pour la consul­ta­tion et la récu­pé­ra­tion de don­nées à par­tir de cer­taines banques : Bio­Mart. Après avoir pas­sé la frus­tra­tion de devoir uti­li­ser l'interface du ser­vice four­ni pour télé­char­ger les dif­fé­rentes don­nées dont j'avais besoin, je me suis ren­sei­gnée davan­tage sur ce logi­ciel. De […]

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• Edito : Retour sur le mois d'avril

  9 mai 2012

  -

  par

  Malicia

  dans Editorial

  

  Bon­jour à toutes et tous 🙂 Vous êtes tou­jours nom­breux à nous visi­ter et nous vous en remer­cions ! Même si l'arrivée de nou­veaux visi­teurs a quelque peu bais­sé pen­dant le mois d'avril, le nombre de ceux qui reviennent sur le site a aug­men­té : nous avons donc des afi­cio­na­dos fidèles. Fire­fox et Chrome conti­nuent à se […]

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• Étude de la régulation de l'épissage alternatif

  4 mai 2012

  -

  par

  Isabelle S. (ZaZo0o)

  dans Découverte

  

  Je vais vous expo­ser dans cet articles un exemple de col­la­bo­ra­tion entre bio­lo­gistes et bio­in­for­ma­ti­ciens afin de répondre à un pro­blème bio­lo­gique com­plexe : l'étude de la régu­la­tion de l'épissage alter­na­tif. Je vais vous pré­sen­ter dans un pre­mier temps le contexte bio­lo­gique, à savoir ce qu'est l'épissage et com­ment il est régu­lé. Puis je vais vous […]

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• Analyse des données de séquençage à ARN

  26 avril 2012

  -

  par

  ademcan

  dans Découverte

  

  Depuis quelques années, le domaine du séquen­çage de l'information géné­tique est ren­tré dans une nou­velle ère : “le séquen­çage de seconde géné­ra­tion”. Cette avan­cée tech­no­lo­gique a per­mis une ana­lyse plus en pro­fon­deur de l'ADN et l'ARN. Nous pou­vons citer par­mi ces nou­velles tech­no­lo­gies le ChIP-seq (Chro­ma­tine Immu­no Pre­ci­pi­ta­tion sequen­cing) ou RNA-seq (Séquen­çage à ARN). Le pro­jet […]

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