• GPGPU, le "supercalculateur" du pauvre

  16 avril 2012

  -

  par

  Mica

  dans Découverte

  

  En bio­in­for­ma­tique, nous sommes sou­vent ame­nés à tra­vailler avec des don­nées à grande échelle. Il suf­fit de voir le nombre de publi­ca­tions incluant les termes “large-scale”, “exten­sive” ou encore “high-through­put” pour s’en rendre compte. Dans la majo­ri­té des cas, on est satis­fait du déve­lop­pe­ment d’un outil quand celui-ci fait son job cor­rec­te­ment en se sou­ciant […]

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• Présentation du Master Bioinformatique de Bordeaux

  12 avril 2012

  -

  par

  nallias

  dans Formation

  

  Présentation Foyer du fon­da­teur de #bioin­fo-fr (ain­si que quelques habi­tués), le Mas­ter de Bio­In­for­ma­tique de l’Université Bor­deaux 1 existe depuis 2003. Les cours sont dis­pen­sés à la fois sur le cam­pus Pessac/​Talence (uni­ver­si­té de Bor­deaux 1) et le cam­pus Car­reire (uni­ver­si­té de Bor­deaux Sega­len). Ces deux cam­pus se par­tagent res­pec­ti­ve­ment les cours du domaine infor­ma­tique […]

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• Débuter avec l'API Ensembl (Perl)

  11 avril 2012

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  par

  tadaima

  dans Découverte

  

  But : Décou­vrir com­ment on peut accé­der très sim­ple­ment aux infor­ma­tions d'Ensembl à l'aide d'un script Perl. Niveau : débu­tant. Pré-requis : Avoir des notions de Perl allant jusqu'à l'utilisation de librai­ries. Avoir accès à une machine où les librai­ries Perl d'Ensembl sont ins­tal­lées. Par­mi les sites agré­geant de l'information bio­lo­gique, Ensem­bl four­nit une API (Appli­ca­tion Pro­gram­ming Inter­face) […]

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• Edito

  5 avril 2012

  -

  par

  Yoann M.

  dans Editorial

  Et bien voi­la, notre pre­mier mois d'existence vient de pas­ser. Encore une fois, mer­ci à vous pour votre toute jeune et fraîche fidé­li­té, nous espè­rons pou­voir vous conten­ter ain­si encore pen­dant long­temps ! L'heure est venue de faire place aux chiffres, car les chiffres parlent tou­jours mieux que des mots.D'après notre outil d'analyse voi­ci ce qu'il […]

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• La métagénomique et les défis pour la bioinformatique au goût #IHMC2012

  4 avril 2012

  -

  par

  Malicia

  dans Conférence

  

  On vous avait dit il y a peu qu'on allait vous par­ler du Congrès inter­na­tio­nal sur le micro­biome humain (Inter­na­tio­nal Human Micro­biome Congress 2012). Pour quelques rai­sons, votre humble ser­vi­teure a tar­dé avec son for­fait. Mais voi­ci que c'est main­te­nant chose faite : nous espé­rons que la frus­tra­tion sera vite oubliée 😉 Je vous avais déjà […]

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• Reconstruction automatique de réseaux métaboliques

  3 avril 2012

  -

  par

  Sylvain P.

  dans Découverte

  

  Le nombre de génomes séquen­cés croît aujourd'hui expo­nen­tiel­le­ment. Il est pro­bable que d'ici peu de temps cha­cun d'entre nous puisse avoir la séquence de son propre génome pour une poi­gnée de dol­lars en quelques jours seule­ment. On peut d'ailleurs se réfé­rer à ce récent débat vidéo, dans lequel inter­vient notam­ment le pro­fes­seur Denis Duboule (géné­ti­cien […]

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• Présentation de l'IUT Génie Biologique option Bioinformatique d'Aurillac

  27 mars 2012

  -

  par

  Akira

  dans Formation

  

  Voi­ci pour cette nou­velle semaine le deuxième article sur les for­ma­tions de bio­in­for­ma­tique en France. Je vais vous pré­sen­ter l'IUT Génie Bio­lo­gique option Bio­in­for­ma­tique d'Aurillac, rat­ta­ché à l'université d’Auvergne. Cette for­ma­tion en deux ans est, à ma connais­sance, la seule qui per­met de com­men­cer la bio­in­for­ma­tique à la sor­tie du lycée. Les étu­diants viennent majo­ri­tai­re­ment […]

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• Edito

  26 mars 2012

  -

  par

  Yoann M.

  dans Editorial

  Nou­velle semaine, nou­veaux articles. Cette semaine encore nous accor­de­rons une place à l'une des for­ma­tions bio­in­for­ma­tique dis­po­nible en France. Il s'agira de l'IUT Bio­in­for­ma­tique d'Aurillac. Notre repor­ter d'excellence devrait éga­le­ment nous faire un petit résu­mé de ce qui s'est pas­sé à l’Inter­na­tio­nal Human Micro­biome Congress 2012. Vous êtes main­te­nant de plus en plus nom­breux à […]

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