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Les 10 ans du World Community Grid
Lire la suite : Les 10 ans du World Community GridLe 16 novembre 2014, le World Community Grid (WCG) fête ses 10 ans d’existence. Créé par IBM en 2004, ce projet de grille de calcul distribué par ordinateur se donne pour mission de soutenir des projets de recherche à fins humanitaires. Selon Wikipedia, une grille de calcul est une infrastructure virtuelle "qui exploite la puissance […]
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Comparaison de structures : le TM-Score
Lire la suite : Comparaison de structures : le TM-ScorePour comparer des structures 3D de protéines, nous avons vu le RMSD dans un précédent article. Je vous propose cette semaine de parler du TM-Score décrit par Zhang et Skolnick en 2004. Les bases Le TM-Score a été développé afin de calculer la qualité des structures de protéines prédites lors de la compétition CASP5. Le but […]
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Hi-C : Quelques bases
Lire la suite : Hi-C : Quelques basesAujourd'hui on va découvrir ensemble une des petites dernières dans la famille des techniques hauts débits : le High Chromosome Contact map (Hi C)[1] . Revenons sur quelques bases : un gène ne pourra être exprimé que si l'ADN qui le code est déplié. Par conséquent les régions dans lesquelles les gènes ne sont pas exprimés sont […]
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Questions à… nos admins
Lire la suite : Questions à… nos adminsCela fait maintenant plusieurs années que Bioinfo-fr.net a été lancé mais connaissez-vous bien les administrateurs de ce site ? Nous vous proposons un entretien croisé de deux de nos administrateurs : Guillaume Collet (Bilouweb) et Isabelle Stévant (ZaZo0o). GC : Bonjour ZaZo0o, merci d'avoir accepter cet entretien croisé, commençons par ton parcours. Qu'est-ce qui t'a menée à la […]
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Portrait ADN bioinformatique
Lire la suite : Portrait ADN bioinformatiqueCe post est le premier d'une nouvelle catégorie du blog vous proposant des articles plus courts et plus légers sur la bioinformatique. Je commence en douceur en vous encourageant à regarder les travaux d'une artiste : Heather Dewey-Hagborg. Les questions posées par son travail et ses recherches sont intéressantes, et à mon avis ne sont plus […]
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ECCB'14 à Strasbourg - le bilan
Lire la suite : ECCB'14 à Strasbourg - le bilanECCB'14 La conférence ECCB 2014 s’est déroulée cette année du 7 au 10 septembre 2014 à Strasbourg. Elle était couplée avec JOBIM et donc co-organisée par la SFBI. La conférence était précédée par 2 journées de workshops et tutoriels. Le programme complet est accessible à l’adresse suivante : www.eccb14.org Les workshops et tutoriels en marge de la conférence […]
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École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)
Lire la suite : École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)Il y a quelque temps, Akira vous présentait l'EMBL en Allemagne. Place maintenant à la Suisse et à sa mythique EPFL, lieu où vous pourrez espérer décrocher un stage ou même poser vos bagages pour un contrat un peu plus long. Histoire et géographie Pour commencer, L'EPFL ne se situe pas tout à fait comme […]
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Le rôle de la bioinformatique dans les labos collaboratifs
Lire la suite : Le rôle de la bioinformatique dans les labos collaboratifsY a-t-il une place pour la bioinformatique dans les structures du type « Do it yourself biology », « Bio-hackers spaces » et autres FabLabs ? Avant de répondre à cette question, quelques précisions sur ces espaces collaboratifs sont nécessaires. Il s’agit de curieux et de passionnés qui se retrouvent dans des caves… ou des laboratoires pour élaborer des projets […]
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