Bioinfo-fr.net

J’ai lu : Quand la vie remplace le silicium

13 novembre 2012

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par

nahoy

dans J'ai lu

Auteurs Dennis Shasha, professeur d'informatique au Courant institute, Université de New York et Cathy Lazere, écrivaine spécialisée en sciences et technologies. Sujet Cet ouvrage retrace le profil d’une quinzaine de scientifiques et s’intéresse aux problématiques et enjeux auxquels ils font face aux frontières de la bioinformatique. Résumé En parallèle avec la carrière de plusieurs chercheurs, ce livre met en évidence les liens qui unissent l'informatique et les sciences du vivants. Séparé en trois parties, on vous montrera comment les mécanismes d'apprentissages et d'évolutions sont intéressants pour la recherche spatiale, puis comment, à partir d'unités biologiques tels que les bactéries ou…
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Projet de livre sur les blogues de science

9 novembre 2012

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par

Les admin·e·s

dans Editorial

L'ASP (Agence Science Presse), en collaboration avec les Éditions MultiMondes, propose en cette fin d'année de recueillir des articles rédigés sur des blogues scientifiques francophones afin de les rassembler dans un livre (plus de détails…). Étant donné la qualité mondialement reconnue de nos articles, nous pensons soumettre deux de nos meilleurs billets au concours. Mais pour cela, nous avons besoin de vous, chers lecteurs. Vous avez jusqu'au mardi 13 novembre dernier délai pour voter pour les deux articles parmi une sélection qui pour vous représentent le mieux notre discipline. --- Vote clos ---Résultats (merci à la cinquantaine de votants) : En…
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ROSALIND : devenez le meilleur bioinformaticien du monde

6 novembre 2012

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par

Yoann M.

dans Découverte

ROSALIND est un nouveau site web commençant à se faire un nom dans le milieu de la bioinformatique. C'est une plateforme permettant d’apprendre la bioinformatique de manière ludique en donnant des problèmes a résoudre. Chez bioinfo-fr on aime bien et on a trouvé judicieux de vous le présenter afin que vous puissiez vous en faire votre propre avis. Bonne découverte ! V.O. uniquement Bon, autant vous prévenir tout de suite : pour les anglophobes il faudra repasser… En effet cette nouvelle ressource est uniquement disponible dans la langue de Shakespeare. Mais peut être que si la sauce prend avec la version bêta…
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Comment détecter, compiler et annoter des facteurs de transcription ?

2 novembre 2012

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par

I. Stévant

dans Journal Club

Après la réunion de rentrée de tous les contributeurs du blog, nous avons décidé d'étendre la rubrique "Journal Club". Ainsi, il est désormais non seulement possible mais aussi fortement recommandé de proposer des billets discutant d'un article en particulier. Nous inaugurons cette extension avec un sujet passionnant : la détection de facteurs de transcription. Bonne lecture 🙂 Ce billet résume un article de revue rédigé sous forme de tutoriel et publié récemment en tant que protocole dans Gene Regulatory Networks : "How do you find transcription factors ? Computational approaches to compile and annotate repertoires of regulators for any genome". Le choix de…
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Monter un serveur de test pour des besoins d’analyses en bioinformatique

30 octobre 2012

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par

Mica

dans Astuce

Dans cet article je vais vous parler d'une facette un peu moins connue de la bioinformatique en vous présentant comment il est possible, à l'heure actuelle, d'assembler un serveur d’analyse bioinformatique avec un budget serré. Il ne s'agit pas d'une étude de marché très poussée mais d'un simple exemple du matériel qu'il est possible d'utiliser pour réaliser un serveur de développement performant. En tant que bioinformaticien, il est important de savoir comment fonctionne une machine, monter soi-même un serveur est un très bon moyen de se familiariser avec le matériel que l'on utilise quotidiennement. De plus, cela n'a rien de bien compliqué et permet de réaliser des économies assez…
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Suivez nous sur les réseaux sociaux

25 octobre 2012

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par

Les admin·e·s

dans Editorial

Vous ne voulez pas rater la sortie du dernier article ? Vous voulez être tenus au courant en temps réel des conférences que nous couvrons ? Bref vous ne pouvez plus vous passer de nous ? Ça tombe bien, vous allez pouvoir nous suivre facilement sur les réseaux sociaux et ce dès aujourd'hui. Bioinfo-fr vient d'ouvrir un compte Twitter et une page Google+ pour être encore plus proche de vous et vous permettre d'avoir de nos nouvelles le plus facilement possible. Dorénavant, en plus de pouvoir suivre les contributeurs branchés sur les différents réseaux, vous pourrez aussi suivre directement les flux officiels de la…
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Tester un système d'exploitation Unix

23 octobre 2012

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par

Edward

dans Découverte

Un biologiste de passage sur bioinfo-fr.net pourra se demander comment tester un système d'exploitation libre tel qu'Ubuntu, sachant qu'il a toujours travaillé sous Windows©. Dans cet article, je donne quelques possibilités permettant d'essayer gratuitement ces systèmes d'exploitations, et ce sans chambouler son ordinateur et ses données… Les explications sont accessibles à tous, mais s'adressent avant tout à des biologistes s’orientant vers la bio-informatique, qui ne possèdent pas des connaissances très étendues sur le sujet.
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ECCB - le bilan

18 octobre 2012

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par

Article Collaboratif

dans Conférence

Cet article a été rédigé par Guillaume Collet, Max et Yoann M. Les auteurs tiennent à remercier Hautbit pour sa relecture et ses commentaires pré-publication. Les 8, 9, 10, 11, et 12 septembre derniers, nous étions à la conférence ECCB 2012 (European Conference on Computational Biology). Nous vous proposons, un mois après, un bilan de ces quelques jours. Évidemment, nous n'avons pas pu assister à toutes les sessions parallèles, n'hésitez donc pas à partager vos impressions si vous étiez parmi nous.
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